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Enregistrement W2216312537 · doi:10.1017/s0022029915000242

Comparison of phenotypic tests for detecting penicillin G resistance with presence of<i>blaZ</i>gene in<i>Staphylococcus aureus</i>isolated from bovine intramammary infections

2015· article· en· W2216312537 sur OpenAlexaff
Norma Russi, Julia Maito, Silvina A Dieser, María Sol Renna, Marcelo Signorini, Cecilia Camussone, Verónica E. Neder, Martín Pol, Tirante Liliana, Liliana Odierno, Luis F. Calvinho

Notice bibliographique

RevueJournal of Dairy Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMilk Quality and Mastitis in Dairy Cows
Établissements canadiensCytodiagnostics (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStaphylococcus aureusPenicillinGenotypeMastitisMicrobiologyPhenotypeGeneBiologyAntibioticsBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Few studies have described the relationship between genotypic and phenotypic methods for detecting penicillin resistance in Staphylococcus aureus isolated from bovine intramammary infection (IMI). Six phenotypic methods for penicillinase detection were compared with a genotypic method testing the presence of the β-lactamase gene blaZ in Staph. aureus (n = 150) isolated from bovine IMI. Highest sensitivities and specificities were observed for disk diffusion (DD) (93 and 97.4%), minimum inhibitory concentration (MIC) (90.3 and 97.4%), Cefinase™ (85.9 and 97.4%) and Diatabs™ (85.7 and 98.7%). The estimated cut-off points estimated in the present study can be considered close to the ones indicated by CLSI (2013). The molecular detection of blaZ gene is the only method that may indicate the real or potential capacity of producing β-lactamase in Staph. aureus. Considering that from a clinical standpoint a false negative result from a phenotypic test is the most unfavourable situation, a combination of standard DD with Diatabs™ or Cefinase™ should be performed by routine mastitis laboratories to minimise false negative results.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,376
Score d'incertitude au seuil0,489

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,372
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations16
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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