MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2217177619 · doi:10.1136/lupus-2015-000112

Characterising the immune profile of the kidney biopsy at lupus nephritis flare differentiates early treatment responders from non-responders

2015· article· en· W2217177619 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueLupus Science & Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSystemic Lupus Erythematosus Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMallinckrodt Pharmaceuticals
Mots-clésMedicineLupus nephritisImmune systemRenal biopsySystemic lupus erythematosusBiopsyInternal medicineKidneyNephritisUrologyImmunologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

INTRODUCTION: The kidney biopsy is used to diagnose and guide initial therapy in patients with lupus nephritis (LN). Kidney histology does not correlate well with clinical measurements of kidney injury or predict how patients will respond to standard-of-care immunosuppression. We postulated that the gene expression profile of kidney tissue at the time of biopsy may differentiate patients who will from those who will not respond to treatment. METHODS: The expression of 511 immune-response genes was measured in kidney biopsies from 19 patients with proliferative LN and 4 normal controls. RNA was extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded kidney biopsies done at flare. After induction therapy, 5 patients achieved a complete clinical response (CR), 10 had a partial response (PR) and 4 patients were non-responders (NRs). Transcript expression was compared with normal controls and between renal response groups. RESULTS: A principal component analysis showed that intrarenal transcript expression from normal kidney, CR biopsies and NR biopsies segregated from each other. The top genes responsible for CR clustering included several interferon pathway genes (STAT1, IRF1, IRF7, MX1, STAT2, JAK2), while complement genes (C1R, C1QB, C6, C9, C5, MASP2) were mainly responsible for NR clustering. Overall, 35 genes were uniquely expressed in NR compared with CR. Pathway analysis revealed that interferon signalling and complement activation pathways were upregulated in both groups, while BAFF, APRIL, nuclear factor-κB and interleukin-6 signalling were increased in CR but suppressed in NR. CONCLUSIONS: These data suggest that molecular profiling of the kidney biopsy at LN flare may be useful in predicting treatment response to induction therapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,227
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,002
Études des sciences et des technologies0,0010,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle