Integrating lung and plasma expression of pneumo-proteins in developing biomarkers in COPD: a case study of surfactant protein D.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Surfactant protein D (SP-D) is a promising blood biomarker in patients with chronic obstructive pulmonary disease (COPD). Nevertheless, circulating levels of SP-D are not related to pulmonary functions. In the present exploratory study, we created a simple index of plasma to bronchoalveolar lavage (BAL) fluid ratio of SP-D (pSP-D/bSP-D), and determined whether this index would relate to the severity of airflow limitation and hence represent a superior biomarker than pSP-D alone. MATERIAL/METHODS: In 50 ex and current smokers (mean age 57.6±7.8 years, 74% men), SP-D was measured in BAL fluid and plasma samples, and the relationships between spirometric variables and a composite parameter - the pSP-D/bSP-D ratio were determined. RESULTS: There was a significant inverse correlation between the pSP-D/bSP-D ratio and the severity of airflow obstruction, as measured by FEV1/FVC (p=0.012). In contrast, no relationship was observed between FEV1/FVC and pSP-D alone. CONCLUSIONS: We suggest that integrating both lung and plasma expression of pneumo-proteins may be more useful than plasma expression alone in developing pneumo-proteins as potential biomarkers in COPD.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».