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Enregistrement W2220222167

Common variants at 12q14 and 12q24 are associated with hippocampal volume

2012· article· en· W2220222167 sur OpenAlexaff
Joshua C. Bis, Charles DeCarli, Albert V. Smith, Fedde van der Lijn, Fabrice Crivello, Myriam Fornage, Stéphanie Debette, Joshua M. Shulman, Helena Schmidt, Velandai Srikanth, Maaike Schuur, Lei Yu, Seung‐Hoan Choi, Sigurður Sigurðsson, Benjamin F.J. Verhaaren, Anita L. DeStefano, Jean‐Charles Lambert, Clifford R. Jack, Maksim Struchalin, Jim Stankovich, Carla A. Ibrahim‐Verbaas, Debra Fleischman, Alex Zijdenbos, Tom den Heijer, Bernard Mazoyer, Laura H. Coker, Christian Enzinger, Patrick Danoy, Najaf Amin, Konstantinos Arfanakis, Mark A. van Buchem, Renée F.A.G. de Bruijn, Alexa Beiser, Carole Dufouil, Juebin Huang, Margherita Cavalieri, Russell Thomson, Wiro J. Niessen, Lori B. Chibnik, Gauti Kjartan Gíslason, Albert Hofman, Aleksandra Pikula, Philippe Amouyel, Kevin B. Freeman, Thanh G. Phan, Ben A. Oostra, Jason L. Stein, Sarah E. Medland, Alejandro Arias Vásquez, Derrek P. Hibar, Margaret J. Wright, Barbara Franke, Nicholas G. Martin, Paul M. Thompson, Michael A. Nalls, André G. Uitterlinden, Rhoda Au, Alexis Elbaz, Richard Beare, John C. van Swieten, Oscar L. López, Tamara B. Harris, Vincent Chouraki, Monique M.B. Breteler, Philip L. De Jager, James T. Becker, Meike W. Vernooij, David S. Knopman, Franz Fazekas, Philip A. Wolf, Aad van der Lugt, Vilmundur Guðnason, W. T. Longstreth, Matthew A. Brown, David A. Bennett, Cornelia M. van Duijn, Thomas H. Mosley, Reinhold Schmidt, Christophe Tzourio, Lenore J. Launer, M. Arfan Ikram, Sudha Seshadri

Notice bibliographique

RevueDigital Access to Scholarship at Harvard (DASH) (Harvard University) · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Eye InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute on AgingNational Institutes of HealthHjartavernd
Mots-clésGenome-wide association studySNPSingle-nucleotide polymorphismHippocampal formationBiologyCognitive declineGeneticsDementiaGenetic associationHippocampusInternal medicineDiseaseEndocrinologyGeneMedicineGenotype
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aging is associated with reductions in hippocampal volume that are accelerated by Alzheimer's disease and vascular risk factors. Our genome-wide association study (GWAS) of dementia-free persons (n = 9,232) identified 46 SNPs at four loci with P values of <4.0 × 10(-7). In two additional samples (n = 2,318), associations were replicated at 12q14 within MSRB3-WIF1 (discovery and replication; rs17178006; P = 5.3 × 10(-11)) and at 12q24 near HRK-FBXW8 (rs7294919; P = 2.9 × 10(-11)). Remaining associations included one SNP at 2q24 within DPP4 (rs6741949; P = 2.9 × 10(-7)) and nine SNPs at 9p33 within ASTN2 (rs7852872; P = 1.0 × 10(-7)); along with the chromosome 12 associations, these loci were also associated with hippocampal volume (P < 0.05) in a third younger, more heterogeneous sample (n = 7,794). The SNP in ASTN2 also showed suggestive association with decline in cognition in a largely independent sample (n = 1,563). These associations implicate genes related to apoptosis (HRK), development (WIF1), oxidative stress (MSR3B), ubiquitination (FBXW8) and neuronal migration (ASTN2), as well as enzymes targeted by new diabetes medications (DPP4), indicating new genetic influences on hippocampal size and possibly the risk of cognitive decline and dementia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,272
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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