Modes and Tempos of Mitochondrial and Chloroplast Genome Evolution in Chlamydomonas: A Comparative Analysis
Notice bibliographique
Résumé
Chlamydomonas mitochondrial and chloroplast genomes, in contrast to the land plant counterparts, exhibit concerted modes and tempos of evolution. The 1.5-fold variation currently observed in the size of both organelle genomes is mostly accounted for by changes in the spacer DNA and intron number, with less contribution from changes in gene content and amount of repeated DNA. Gene order is highly variable in both mitochondrial and chloroplast genomes of Chlamydomonas, the level of gene rearrangement being correlated with the abundance of short dispersed repeated sequences throughout the genome. Intron-containing-, fragmented-, and fragmented and scrambled coding regions are common features of mitochondrial and chloroplast gene structure and organization within the group. The level of ribosomal RNA gene sequence divergence in both mitochondrial and chloroplast genomes is higher in the Chlamydomonas lineage than in land plants and is most likely due to higher rates of nucleotide substitution in Chlamydomonas organellar DNAs. The mechanisms as well as the selective pressures that shaped the organellar genomes in the Chlamydomonas lineage remain to be explained.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».