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Enregistrement W2220881030 · doi:10.1158/1940-6207.capr-15-0291

Uninterrupted Sedentary Behavior Downregulates <i>BRCA1</i> Gene Expression

2015· article· en· W2220881030 sur OpenAlexaff
Rachael Pettapiece-Phillips, Max Kotlyar, Rania Chehade, Leonardo Salmena, Steven A. Narod, Mohammad R. Akbari, Igor Jurišica, Joanne Kotsopoulos

Notice bibliographique

RevueCancer Prevention Research · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNutrition, Genetics, and Disease
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentrePublic Health OntarioWomen's College HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneGene expressionBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BRCA1 mutation carriers face a high lifetime risk of developing breast cancer. Physical activity induces broad transcriptional changes, and multiple studies have documented its beneficial effects across cancers. Because haploinsufficiency predisposes to breast cancer in these women, factors that increase BRCA1 levels may mitigate the effect of the mutation. Whether physical activity modulates BRCA1 expression and whether lifestyle factors could benefit women with a mutation remain unclear. The objective of this study was to systematically evaluate whether physical activity or sedentary behavior affects BRCA1 mRNA expression. Activity levels were assessed in 50 female participants (14 BRCA1 mutation carriers and 36 noncarriers) using the GT3X Actigraph accelerometer, and BRCA1 mRNA expression was quantified from peripheral blood lymphocytes using the Nanostring nCounter Analysis System. There was a significant negative correlation between the longest sedentary bout and BRCA1 mRNA expression (ρ = -0.32; P = 0.02). Women below the median for the longest sedentary bout had significantly higher BRCA1 mRNA levels compared with women above the median (161 vs. 132 counts; P = 0.04; one-sided Mann-Whitney U test). There was no significant relationship between mean metabolic equivalents of task rate or mean sedentary time and BRCA1 mRNA expression (Spearman correlation P ≥ 0.75; P ≥ 0.14; Mann-Whitney U test). These findings suggest that prolonged periods of sedentary behavior are associated with significantly lower BRCA1 mRNA expression. Whether this translates into a potentially more harmful effect in BRCA1 mutation carriers warrants further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,099
Tête enseignante GPT0,421
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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