Molecular Basis for Phosphorylation-dependent SUMO Recognition by the DNA Repair Protein RAP80
Notice bibliographique
Résumé
Recognition and repair of double-stranded DNA breaks (DSB) involves the targeted recruitment of BRCA tumor suppressors to damage foci through binding of both ubiquitin (Ub) and the Ub-like modifier SUMO. RAP80 is a component of the BRCA1 A complex, and plays a key role in the recruitment process through the binding of Lys(63)-linked poly-Ub chains by tandem Ub interacting motifs (UIM). RAP80 also contains a SUMO interacting motif (SIM) just upstream of the tandem UIMs that has been shown to specifically bind the SUMO-2 isoform. The RAP80 tandem UIMs and SIM function collectively for optimal recruitment of BRCA1 to DSBs, although the molecular basis of this process is not well understood. Using NMR spectroscopy, we demonstrate that the RAP80 SIM binds SUMO-2, and that both specificity and affinity are enhanced through phosphorylation of the canonical CK2 site within the SIM. The affinity increase results from an enhancement of electrostatic interactions between the phosphoserines of RAP80 and the SIM recognition module within SUMO-2. The NMR structure of the SUMO-2·phospho-RAP80 complex reveals that the molecular basis for SUMO-2 specificity is due to isoform-specific sequence differences in electrostatic SIM recognition modules.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».