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Enregistrement W2221720933 · doi:10.3390/ijms161226216

Histone H2AX Is Involved in FoxO3a-Mediated Transcriptional Responses to Ionizing Radiation to Maintain Genome Stability

2015· article· en· W2221720933 sur OpenAlexafffund
Stephane Tarrade, Tanya Bhardwaj, Matthew C. Flegal, Lindsey Bertrand, Ilya O. Velegzhaninov, Alexey Moskalev, Dmitry Klokov

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensCanadian Nuclear Laboratories
Organismes subventionnairesRussian Academy of SciencesAtomic Energy of Canada Limited
Mots-clésIonizing radiationHistoneGenomeBiologyGeneticsNon-ionizing radiationGenome instabilityComputational biologyCell biologyDNA damageDNAGeneIrradiationPhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Histone H2AX plays a crucial role in molecular and cellular responses to DNA damage and in the maintenance of genome stability. It is downstream of ataxia telangiectasia mutated (ATM) damage signaling pathway and there is an emerging role of the transcription factor FoxO3a, a regulator of a variety of other pathways, in activating this signaling. We asked whether H2AX may feedback to FoxO3a to affect respective FoxO3a-dependent pathways. We used a genetically matched pair of mouse embryonic fibroblast H2AX(+/+) and H2AX(-/-) cell lines to carry out comprehensive time-course and dose-response experiments and to show that the expression of several FoxO3a-regulated genes was altered in H2AX(-)(/-) compared to H2AX(+/+) cells at both basal and irradiated conditions. Hspa1b and Gadd45a were down-regulated four- to five-fold and Ddit3, Cdkn1a and Sod2 were up-regulated 2-3-fold in H2AX(-/-) cells. Using the luciferase reporter assay, we directly demonstrated that transcriptional activity of FoxoO3a was reduced in H2AX(-/-) cells. FoxO3a localization within the nuclear phospho-ATM (Ser1981) foci in irradiated cells was affected by the H2AX status, as well as its posttranslational modification (phospho-Thr32). These differences were associated with genomic instability and radiosensitivity in H2AX(-/-) cells. Finally, knockdown of H2AX in H2AX(+/+) cells resulted in FoxO3a-dependent gene expression patterns and increased radiosensitivity that partially mimicked those found in H2AX(-/-) cells. Taken together, our data suggest a role for FoxO3a in the maintenance of genome integrity in response to DNA damage that is mediated by H2AX via yet unknown mechanisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,325
Score d'incertitude au seuil0,502

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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