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Enregistrement W2222506336 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e15093

Association of upregulated GATA-4 transcription factor colorectal adenocarcinoma with metastatic and primary tumors

2009· article· en· W2222506336 sur OpenAlexaff
Esmeralda Celia Marginean, Goran Torlakovic, Heather Neufeld, EE Torlakovic

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMetastasis and carcinoma case studies
Établissements canadiensRoyal University HospitalOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineAdenocarcinomaImmunohistochemistryColorectal cancerPathologyAngiogenesisTranscription factorCancer researchInternal medicineCancerBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e15093 Background: GATA-4 zinc finger transcription factor is involved in regulation of cellular development, proliferation, and differentiation and is important in embryonic development of gastrointestinal tract. However, GATA-4 is not expressed in normal adult colonic mucosa. Its protein expression in colonic adenocarcinoma has not been systematically evaluated and small number of samples was previously reported as negative. Nuclear factor-B (NF-B) activation was shown to promote the growth of the colon tumors in experimental models and was correlated with tumor angiogenesis and progression in human colorectal cancer. Methods: Forty cases of colorectal adenocarcinoma were evaluated. The benign colonic mucosa and the matching metastatic tumors of the same patients were also included in the study. TMAs which included 139 samples were evaluated by immunohistochemistry and nuclear and cytoplasmic GATA-4 expression was scored (0–3+). NF-B activation was detected as nuclear reactivity for p65. Results: GATA-4 was expressed in 32% of colorectal adenocarcinoma, but not in benign colonic mucosa (p=0.0001, Chi-Square). GATA-4 was also significantly more expressed in metastatic (41%) than in primary (21%) colorectal adenocarcinoma (p<0.0001, Chi-Square). NF-B activation was not present in any of the samples of benign colonic mucosa, but it was detected in 64% adenocarcinomas (p<0.0001, Chi-Square). While there was no difference in NF-B activation between primary vs. metastatic adenocarcinoma, a strong positive association between GATA-4 expression and NF-B activation (p<0.0001, Linear-by- Linear) was found. Conclusions: GATA-4, a developmental transcription factor is not expressed by normal colonic mucosa, but is present in 1/5 of primary tumors that gave rise to distant metastases and in almost 1/2 of their respective metastases. GATA- 4 is also strongly positively associated with NF-B activation previously described to have a role in human cancer progression. GATA-4 may have a role in colorectal adenocarcinoma development and progression and it should be further evaluated in prospective studies as a putative adverse prognostic factor in colorectal adenocarcinoma. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,212
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,386
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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