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Enregistrement W2222665439 · doi:10.1021/acs.jmedchem.5b01635

8-Substituted Pyrido[3,4-<i>d</i>]pyrimidin-4(3<i>H</i>)-one Derivatives As Potent, Cell Permeable, KDM4 (JMJD2) and KDM5 (JARID1) Histone Lysine Demethylase Inhibitors

2016· article· en· W2222665439 sur OpenAlexfundno aff
Vassilios Bavetsias, Rachel M. Lanigan, G.F. Ruda, Butrus Atrash, Mark McLaughlin, Anthony Tumber, N. Yi Mok, Yann‐Vaï Le Bihan, Sally Dempster, K. Boxall, Fiona Jeganathan, Stephanie B. Hatch, P. Savitsky, Srikannathasan Velupillai, T. Krojer, Katherine S. England, Jimmy J. P. Sejberg, Ching Thai, Adam Donovan, Ákos Pál, Giuseppe Scozzafava, James M. Bennett, Akane Kawamura, C. Johansson, A. Szykowska, C. Gileadi, N. Burgess-Brown, F. von Delft, Udo Oppermann, Zoë S. Walters, Janet Shipley, Florence I. Raynaud, Susan M. Westaway, Rab K. Prinjha, Oleg Fedorov, Rosemary Burke, Christopher J. Schofield, Isaac M. Westwood, C. Bountra, Susanne Müller, Rob L. M. van Montfort, Paul E. Brennan, Julian Blagg

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilEngineering and Physical Sciences Research CouncilNovartis PharmaMinistero dello Sviluppo EconomicoGenome CanadaFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloCancer Research UKOntario Ministry of Economic Development and InnovationNational Institute for Health and Care ResearchWellcome TrustEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsWellcomeRoyal Marsden NHS Foundation TrustPfizerAvon Foundation for Women
Mots-clésChemistryDemethylaseH3K4me3StereochemistryDemethylationMoietyLinkerHeLaLysinePyrazoleHistoneBiochemistryCellAmino acid

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We report the discovery of N-substituted 4-(pyridin-2-yl)thiazole-2-amine derivatives and their subsequent optimization, guided by structure-based design, to give 8-(1H-pyrazol-3-yl)pyrido[3,4-d]pyrimidin-4(3H)-ones, a series of potent JmjC histone N-methyl lysine demethylase (KDM) inhibitors which bind to Fe(II) in the active site. Substitution from C4 of the pyrazole moiety allows access to the histone peptide substrate binding site; incorporation of a conformationally constrained 4-phenylpiperidine linker gives derivatives such as 54j and 54k which demonstrate equipotent activity versus the KDM4 (JMJD2) and KDM5 (JARID1) subfamily demethylases, selectivity over representative exemplars of the KDM2, KDM3, and KDM6 subfamilies, cellular permeability in the Caco-2 assay, and, for 54k, inhibition of H3K9Me3 and H3K4Me3 demethylation in a cell-based assay.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,251
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations98
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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