To invade or not to invade: two approaches to a prokaryotic predatory life cycle
Notice bibliographique
Résumé
Bdellovibrio and like organisms (BALOs) are a group of Gram-negative bacterial predators that are defined as having a periplasmic life cycle, whereby the predator enters into the periplasm of a prey cell. Recently, a predator of Caulobacter crescentus with a novel epibiotic life cycle was identified as a new species - Bdellovibrio exovorus. Therefore, this raises the question as to what determines the type of life cycle of a predator. Six bacterial strains susceptible to predation by B. exovorus JSS were isolated from soil, sewage, and activated sludge. 16S rRNA gene sequence analysis revealed these prey cells to be Acinetobacter johnsonii, Acinetobacter junii, Aeromonas hydrophila, and Delftia acidovorans. The life cycle of B. exovorus was epibiotic on all these prey cells. Environmental samples were enriched with these prey cells; new BALOs were isolated and their life cycle assessed. All new isolates had a periplasmic life cycle. BALOs generally have diverse prey ranges, and thus, not all new prey cells could be used by each new predator. Overall, each prey cell was able to support the growth of predators with either life cycle. Therefore it was confirmed that it is the predator and not the prey that determines the type of life cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».