MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2225105236 · doi:10.1016/j.jalz.2015.06.047

IC‐P‐027: Dynamics of longitudinal biomarker changes in the Mcgill‐R‐Thy1‐APP RAT

2015· article· en· W2225105236 sur OpenAlexaffabout
Monica Shin, Maxime Parent, Vladimir Fonov, Min-Su Kang, Axel Mathieu, S.T.M. Allard, Sonia Do Carmo, Serge Gauthier, A. Claudio Cuello, Pedro Rosa‐Neto

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBioinformatics and Genomic Networks
Établissements canadiensMcGill Genome CentreDouglas Mental Health University InstituteDouglas CollegeMcGill UniversityMcGill University Health CentreTranslational Research in Oncology
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVoxelSomatosensory systemNeuroscienceTemporal lobeBiomarkerGenetically modified mouseNeuroimagingPathologyNuclear medicineInternal medicinePsychologyChemistryMedicineTransgeneBiochemistryRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Rat transgenic models of human brain amyloidosis constitute a unique opportunity to explore the impact of amyloid pathology on imaging biomarkers without the bias of tau pathology invariably present in the human brain. Due to its size, the McGill-R-Thy1-APP rat is ideal for multi-modal neuroimaging observations as compared to transgenic mouse. Here, we studied the associations between the rates of structural brain remodeling as a function of the rate of progression of hypometabolism in transgenic rats. We hypothesize regional specific interactions between biomarkers. McGill-R-Thy1-APP rat (n=9) and wild type (wt; n=12) had [18F]FDG and structural MRIs scans at 11-month (baseline) and 16-month (follow-up). Structural images were acquired using a Bruker 70/30USR Biospect MRI (FISP; TE/TR: 2.5/5.0ms; FOV: 3.6cm3; isotropic 250um voxels; 8 angles). Voxel-based morphometry was performed to obtain longitudinal deformation maps. [18F]FDG PET images were acquired and analyzed as described previously (3). For both scans, longitudinal difference maps were generated. Global uptake values obtained from these maps were then correlated with structural deformation maps using a voxel-level linear model. The olfactory bulb, anterior pituitary lobe, multiple cortical areas, lateral ventricle, and a portion of the hippocampus showed association between [18F]FDG declines and structural shrinkage. The left motor cortex and thalamic nuclei as well as the right primary somatosensory cortex showed dissociation between structural changes (expansion) and [18F]FDG declines. McGill-R-Thy1-APP allows for longitudinal biomarker measures without confounding effects of neurofibrillary tangles or cell death. In fact, the present results suggest that brain abnormal amyloid aggregates present in the McGill-R-Thy1-APP rat leads to expansion or shrinkage of grey matter structures and progressive hypometabolism. However these processes occur in synchrony in specific brain regions. These suggest a complex interface between amyloid pathology and pathophysiological mechanisms involved in structural declines in transgenic animals. t-stat map of regions that shrink when the metabolism decreases throughout the brain. t-stat map of regions that expand when the metabolism decreases throughout the brain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAlzheimer s & Dementia→Même sujetBioinformatics and Genomic Networks→Travaux en français237 207→