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Enregistrement W2225545997 · doi:10.6000/1927-3037.2015.04.03.2

FluDen Primer DB –PCR Primer Database for Influenza A and Dengue Virus

2015· article· es· W2225545997 sur OpenAlexvenueno aff
Raghavendra Krishnappa, Rajendran Paramasivam

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biotechnology for Wellness Industries · 2015
Typearticle
Languees
DomaineMedicine
ThématiqueMosquito-borne diseases and control
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPrimer (cosmetics)Dengue feverDengue virusBiologyVirologyPolymerase chain reactionComputational biologyPrimer dimerIn silicoDatabaseGeneGeneticsComputer scienceMultiplex polymerase chain reaction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

FluDen Primer Database (http://www.fludenpdb.com) has been designed and developed as a web application program to provide free access to the in-silico designed multiple potential primers for PCR detection and quantification assays for Influenza and dengue viruses. This program also permits user to submit sequence of their choice for primer design. The database contains primer records for Influenza and dengue viruses which cause infection in Humans. As of 2014 there are 142 primer sets for screening 32 genes/regions of Influenza and dengue viruses together. Application contain gene information, assay details such as oligonucleotide sequence, primer properties and reaction conditions, publication information. We have developed a resource, FluDen Primer DB which contains primer that can be used for PCR under provided amplification conditions for each primer pair. A distinguish feature of the FlueDen is the primers listed in DB are the products of PCR design application which are experimentally validated. Primers for the FluDen were designed using current genomic information available from the National Center for Biotechnology Information (NCBI).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,823
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,349
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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