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Enregistrement W2225951295 · doi:10.1084/jem.20141898

Loss of <i>Tifab</i>, a del(5q) MDS gene, alters hematopoiesis through derepression of Toll-like receptor–TRAF6 signaling

2015· article· en· W2225951295 sur OpenAlexafffund
Melinda E. Varney, Madeline Niederkorn, Hiroyasu Konno, Takayuki Matsumura, Jin Gohda, Nobuaki Yoshida, Taishin Akiyama, Susanne Christie, Jing Fang, David M. Miller, Andrés Jerez, Aly Karsan, Jaroslaw P. Maciejewski, Ruhikanta A. Meetei, Jun‐ichiro Inoue, Daniel T. Starczynowski

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Experimental Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueNF-κB Signaling Pathways
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institute of Environmental Health SciencesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyHaematopoiesisMyeloidProgenitor cellCancer researchBone marrowInnate immune systemImmunologySignal transductionStem cellBone marrow failureImmune systemCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

TRAF-interacting protein with forkhead-associated domain B (TIFAB) is a haploinsufficient gene in del(5q) myelodysplastic syndrome (MDS). Deletion of Tifab results in progressive bone marrow (BM) and blood defects, including skewed hematopoietic stem/progenitor cell (HSPC) proportions and altered myeloid differentiation. A subset of mice transplanted with Tifab knockout (KO) HSPCs develop a BM failure with neutrophil dysplasia and cytopenia. In competitive transplants, Tifab KO HSPCs are out-competed by wild-type (WT) cells, suggesting a cell-intrinsic defect. Gene expression analysis of Tifab KO HSPCs identified dysregulation of immune-related signatures, and hypersensitivity to TLR4 stimulation. TIFAB forms a complex with TRAF6, a mediator of immune signaling, and reduces TRAF6 protein stability by a lysosome-dependent mechanism. In contrast, TIFAB loss increases TRAF6 protein and the dynamic range of TLR4 signaling, contributing to ineffective hematopoiesis. Moreover, combined deletion of TIFAB and miR-146a, two genes associated with del(5q) MDS/AML, results in a cooperative increase in TRAF6 expression and hematopoietic dysfunction. Re-expression of TIFAB in del(5q) MDS/AML cells results in attenuated TLR4 signaling and reduced viability. These findings underscore the importance of efficient regulation of innate immune/TRAF6 signaling within HSPCs by TIFAB, and its cooperation with miR-146a as it relates to the pathogenesis of hematopoietic malignancies, such as del(5q) MDS/AML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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