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Enregistrement W2226351303 · doi:10.1093/hmg/ddv434

Common variants in<i>DRD2</i>are associated with sleep duration: the CARe consortium

2015· review· en· W2226351303 sur OpenAlexaff
Brian E. Cade, Daniel J. Gottlieb, Diane S. Lauderdale, David A. Bennett, Aron S. Buchman, Sarah G. Buxbaum, Philip L. De Jager, Daniel S. Evans, Tibor Fülöp, Sina A. Gharib, W. Craig Johnson, Hyun Kim, Emma K. Larkin, Seung Ku Lee, Andrew Lim, Naresh M. Punjabi, Chol Shin, Katie L. Stone, Gregory J. Tranah, Jia Weng, Kristine Yaffe, Phyllis C. Zee, Sanjay R. Patel, Xiaofeng Zhu, Susan Redline, Richa Saxena

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2015
Typereview
Langueen
DomainePsychology
ThématiqueSleep and related disorders
Établissements canadiensHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science CentreCanadian Sleep & Circadian Network
Organismes subventionnairesNational Institute on Minority Health and Health DisparitiesNational Center for Research ResourcesNational Human Genome Research InstituteNational Institute on AgingUniversity of California, DavisNational Institute of Neurological Disorders and StrokeUniversity of Alabama at BirminghamNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteCase Western Reserve UniversityEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentBroad InstituteKorea Centers for Disease Control and PreventionUniversity of PittsburghJohns Hopkins UniversityNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesUniversity of ArizonaUniversity of MinnesotaKaiser Foundation Research InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteBoston UniversityNorthwestern University
Mots-clésGenome-wide association studyCandidate geneSleep (system call)PolysomnographyMedicineGenetic associationPsychologyPsychiatrySingle-nucleotide polymorphismGeneticsGenotypeBiologyGeneElectroencephalography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sleep duration is implicated in the etiologies of chronic diseases and premature mortality. However, the genetic basis for sleep duration is poorly defined. We sought to identify novel genetic components influencing sleep duration in a multi-ethnic sample. Meta-analyses were conducted of genetic associations with self-reported, habitual sleep duration from seven Candidate Gene Association Resource (CARe) cohorts of over 25 000 individuals of African, Asian, European and Hispanic American ancestry. All individuals were genotyped for ∼50 000 SNPs from 2000 candidate heart, lung, blood and sleep genes. African-Americans had additional genome-wide genotypes. Four cohorts provided replication. A SNP (rs17601612) in the dopamine D2 receptor gene (DRD2) was significantly associated with sleep duration (P = 9.8 × 10(-7)). Conditional analysis identified a second DRD2 signal with opposite effects on sleep duration. In exploratory analysis, suggestive association was observed for rs17601612 with polysomnographically determined sleep latency (P = 0.002). The lead DRD2 signal was recently identified in a schizophrenia GWAS, and a genetic risk score of 11 additional schizophrenia GWAS loci genotyped on the IBC array was also associated with longer sleep duration (P = 0.03). These findings support a role for DRD2 in influencing sleep duration. Our work motivates future pharmocogenetics research on alerting agents such as caffeine and modafinil that interact with the dopaminergic pathway and further investigation of genetic overlap between sleep and neuro-psychiatric traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,966
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,039
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,295 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations51
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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