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Enregistrement W2226358409 · doi:10.1016/j.gendis.2015.08.001

Direct lineage conversion with pluripotency factors: A risky detour through transient pluripotency?

2015· article· en· W2226358409 sur OpenAlexafffund
Fei Li, Jim Hu

Notice bibliographique

RevueGenes & Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick ChildrenSickKids Foundation
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchU.S. Public Health Service
Mots-clésLineage (genetic)Transient (computer programming)Computer scienceBiologyComputational biologyCell biologyGeneticsGeneOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The advent of induced pluripotent stem cells (iPSCs) marked a giant step forward towards the reality of converting one type of primary somatic cells into different lineages capable of clinically repairing damaged tissues and organs. However, the major drawbacks of iPSCs hinder their quick translation to the bedside. These drawbacks include the time-, cost-, and labor-intensive process in production of clinical products from iPSCs, and the inherent risk of long-term tumorigenesis due to the forced expression of transcription factors associated with pluripotency, which are often implicated as aberrations within the cancerous gene circuitry. The recent reports of the direct conversion of one somatic lineage into other types following a short-term pulse of pluritotent transcription factors pointed to a more efficient and more lineage–versatile alternative to those using only lineage-restricted transcription factors.1,2 This new approach has also been applauded for its perceived safety merits due to need for fewer perturbations of the genes in the target cells and, perhaps, without generating “true” iPSCs. However, the question remains whether this short-term approach represents a mechanistically different method, which avoids the total erasure of restricted epigenetic imprints as does iPSCs generation, and whether it therefore bypasses the pluripotency stage.3,4 Two recent articles published in the same issue of Nature Biotechnology offered some definitive answers.5,6 Using different, but reliable lineage tracing methods, the two groups of scientists came to the same conclusion that the majority of the converted new lineage offspring cells did indeed come from the intermediate precursors reprogrammed through the short-term pulse of transcription factors. These precursors bear the genomic and proteomic hallmarks, as well as having biological properties, similar to those found in iPSCs. Although the short-term approach still has its merits of efficiency and simplicity when generating desired somatic lineages for research and clinical application, these fresh insights will certainly shape the guidebook for its clinical translation, which requires that the risk of tumorigenesis be examined with the same rigor as in the case of iPSC-derived lineage cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,209
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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