MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2226699979 · doi:10.1177/2049936115624630

The implications of whole-genome sequencing in the control of tuberculosis

2015· review· en· W2226699979 sur OpenAlex
Robyn S. Lee, Marcel A. Behr

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueTherapeutic Advances in Infectious Disease · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTuberculosisMycobacterium tuberculosisWhole genome sequencingData scienceMedicineRisk analysis (engineering)Computer scienceGenomeBiologyGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The availability of whole-genome sequencing (WGS) as a tool for the diagnosis and clinical management of tuberculosis (TB) offers considerable promise in the fight against this stubborn epidemic. However, like other new technologies, the best application of WGS remains to be determined, for both conceptual and technical reasons. In this review, we consider the potential value of WGS in the clinical laboratory for the detection of Mycobacterium tuberculosis and the prediction of antibiotic resistance. We also discuss issues pertaining to data generation, interpretation and dissemination, given that WGS has to date been generally performed in research labs where results are not necessarily packaged in a clinician-friendly format. Although WGS is far more accessible now than it was in the past, the transition from a research tool to study TB into a clinical test to manage this disease may require further fine-tuning. Improvements will likely come through iterative efforts that involve both the laboratories ready to move TB into the genomic era and the front-line clinical/public health staff who will be interpreting the results to inform management decisions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,985
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,061
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,348 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle