MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2227301701 · doi:10.1007/s00705-018-3723-z

Taxonomy of prokaryotic viruses: 2017 update from the ICTV Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee

2018· article· en· W2227301701 sur OpenAlexaff
Evelien M. Adriaenssens, Johannes Wittmann, Jens H. Kuhn, Dann Turner, Matthew B. Sullivan, Bas E. Dutilh, Ho Bin Jang, Leonardo Joaquim van Zyl, Jochen Klumpp, Małgorzata Łobocka, Andrea I. Moreno‐Switt, J. Rumnieks, Robert A. Edwards, Jumpei Uchiyama, Poliane Alfenas‐Zerbini, Nicola K. Petty, Andrew M. Kropinski, Jakub Barylski, Annika Gillis, Martha R. J. Clokie, David Prangishvili, Rob Lavigne, Ramy K. Aziz, Siobain Duffy, Mart Krupovìč, Minna M. Poranen, Petar Knežević, François Enault, Yigang Tong, Hanna M. Oksanen, J. Rodney Brister

Notice bibliographique

RevueArchives of Virology · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesBattelleNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekFonds Wetenschappelijk OnderzoekVlaamse regeringFonds De La Recherche Scientifique - FNRSAcademy of FinlandUniversity of PittsburghHelsingin YliopistoNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyVirus classificationVirologyTaxonomy (biology)Biological classificationComputational biologyEvolutionary biologyGeneticsGenomeZoologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,059

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0110,009
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0030,006
Science ouverte0,0030,004
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations267
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentnon

Explorer davantage

Même revueArchives of VirologyMême sujetBacteriophages and microbial interactionsTravaux en français237 207