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Enregistrement W2227449736 · doi:10.1094/phyto-02-15-0043-r

Regional and Temporal Population Structure of <i>Pseudoperonospora cubensis</i> in Michigan and Ontario

2016· article· en· W2227449736 sur OpenAlexaffabout
Rachel P. Naegele, L. M. Quesada-Ocampo, J. D. Kurjan, C. Saude, M. K. Hausbeck

Notice bibliographique

RevuePhytopathology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensOntario Tobacco Research Unit
Organismes subventionnairesAnimal and Plant Health Inspection ServiceNational Institute of Food and AgriculturePickle Packers InternationalU.S. Department of Agriculture
Mots-clésPseudoperonospora cubensisBiologyDowny mildewOomyceteSporangiumPopulationGenetic diversityGenetic structureObligateGrowing seasonBotanyPathogenSporeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cucurbit downy mildew (CDM), caused by the oomycete pathogen Pseudoperonospora cubensis, is a devastating disease that affects cucurbit species worldwide. This obligate, wind-dispersed pathogen does not overwinter in Michigan or other northern regions and new isolates can enter the state throughout the growing season. To evaluate the regional and temporal population structure of P. cubensis, sporangia from CDM lesions were collected from cucurbit foliage grown in Michigan and Ontario field locations in 2011. Population structure and genetic diversity were assessed in 257 isolates using nine simple sequence repeat markers. Genetic diversity was high for isolates from Michigan and Canada (0.6627 and 0.6131, respectively). Five genetic clusters were detected and changes in population structure varied by site and sampling date within a growing season. The Michigan and Canada populations were significantly differentiated, and a unique genetic cluster was detected in Michigan.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,475
Score d'incertitude au seuil0,771

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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