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Enregistrement W2228217001 · doi:10.1093/cid/civ041

Longitudinal Clinical Findings and Outcome Among Patients With <i>Cryptococcus gattii</i> Infection in British Columbia

2015· article· en· W2228217001 sur OpenAlexaffabout
Peter Phillips, Eleni Galanis, Laura MacDougall, Mei Y. Chong, Robert Balshaw, Victoria Cook, William Bowie, Theodore S. Steiner, Linda Hoang, Muhammad Morshed, Wayne Ghesquière, David M. Forrest, Diane Roscoe, Patrick Doyle, Pamela Kibsey, Thomas Connolly, Yazdan Mirzanejad, Darby Thompson, John C. Saliken, Bruce Sanders, Eric Partlow, J Vortel, Yasmin Y. Arikan, Murray Fyfe

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFungal Infections and Studies
Établissements canadiensSurrey Memorial HospitalUniversity of British ColumbiaBC Centre for Disease ControlVancouver General HospitalSt. Paul's HospitalRoyal Jubilee Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineCryptococcus gattiiInternal medicineAsymptomaticHazard ratioProportional hazards modelCryptococcosisConfidence intervalLogistic regressionGastroenterologySurgeryImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cryptococcus gattii (Cg) infection emerged in British Columbia in 1999. A longitudinal, clinical description of patients has not been reported. METHODS: Medical records were reviewed for Cg patients identified through surveillance (1999-2007). Risk factors for Cg mortality were explored using multivariate Cox regression; longitudinal patterns in serum cryptococcal antigen (SCrAg) titers and the probability of chest cryptococcomas over time were estimated using cubic B-splines in mixed-effects regression models. RESULTS: Among 152 patients, 111 (73.0%) were culture confirmed. Isolated lung infection was present in 105 (69.1%) patients; 47 (30.9%) had central nervous system infection, with or without lung involvement. Malignancy was the provisional diagnosis in 64 (42.1%) patients. Underlying diseases were present in 91 (59.9%) patients; 23 (15.1%) were immunocompromised, and 23 (15.1%) had asymptomatic disease. There were only 2 (1.8%) culture positive relapses, both within 12 months of follow-up. The estimated median time to resolution of lung cryptococcomas and decline in SCrAg titer to <1:8 was 2.8 and 2.9 years, respectively. Cg-related and all-cause mortality among culture-confirmed cases at 12 months' follow-up was 23.3% and 27.2%, respectively. Cg-related mortality was associated with age >50 years (hazard ratio [HR], 15.6; 95% confidence interval [CI], 1.9-130.5) and immunocompromise (HR, 5.8; CI, 1.5-21.6). All Cg-related mortality occurred among culture-positive cases within 1 year of diagnosis. CONCLUSIONS: Cryptococcomas and serum antigenemia were slow to resolve. However, late onset of failed therapy or relapse was uncommon, suggesting that delayed resolution of these findings does not require prolongation of treatment beyond that recommended by guidelines.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,296
Score d'incertitude au seuil0,595

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,053
Tête enseignante GPT0,357
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations56
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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