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Enregistrement W2230094502 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.11029

Epidermal growth factor (EGF) gene polymorphism, gastroesophageal reflux disease (GERD), and esophageal adenocarcinoma (EAC) risk

2009· article· en· W2230094502 sur OpenAlexaff
Winson Y. Cheung, Rihong Zhai, Matthew H. Kulke, Rebecca S. Heist, Kofi Asomaning, Changgeng Ma, Z. Wang, Liya Su, David C. Christiani, G. Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGERDMedicineGastroenterologyInternal medicineSingle-nucleotide polymorphismRisk factorOdds ratioGenotypeOncologyDiseaseRefluxBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

11029 Background: Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of key cancer genes, such as EGF A61G, are associated with an elevated risk of EAC, but the lack of full penetrance indicates that the effects of these SNPs on esophageal carcinogenesis are modified by additional genetic or environmental variables. Since GERD is an established risk factor for EAC, we evaluated whether the association between EGF polymorphism and EAC development is altered by the presence of GERD. Methods: EGF genotyping of DNA samples was performed and GERD history was collected for 309 EAC patients and 275 matched healthy controls. Associations between genotypes and EAC risk were examined with adjusted logistic regression. Genotype-GERD relationships were explored using analyses stratified by GERD history and joint effects models that considered severity and duration of GERD symptoms. Results: Baseline characteristics were comparable between cases and controls except that EGF variants (A/G or G/G) were more common (p=0.02) and GERD was more prevalent (p<0.001) in cases than in controls. When compared to the EGF wild type A/A genotype, the G/G variant was associated with an increased risk of EAC (OR 1.9; 95% CI, 1.2–3.0; p=0.007). Stratified analyses revealed that the G/G variant contributed to a substantial increase in EAC risk among individuals with GERD, but a slight decrease in risk for GERD-free individuals (see table). In the joint effects models, the odds of EAC was also highest for G/G patients who either experienced frequent GERD of more than once per week (OR 21.8; 95% CI, 5.1–94.0; p<0.001) or suffered GERD for longer than 15 years (OR 22.4; 95% CI, 6.5–77.6; p<0.001). There was a highly significant interaction between the G/G genotype and the presence of GERD (p<0.001). Conclusions: EGF A61G polymorphism exerts its effect on EAC susceptibility through an interaction with GERD. Performing EGF genotyping for patients with severe or longstanding GERD can help to identify individuals at the greatest risk of EAC. [Table: see text] No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,083
Tête enseignante GPT0,432
Écart entre enseignants0,350 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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