Use of carbonic anhydrase IX (CAIX) expression and Von Hippel Lindau (VHL) gene mutation status to predict survival in renal cell carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
5042 Background: VHL gene mutations induce the expression of CAIX, and previous studies have shown that low CAIX results in worse prognosis for RCC. We attempt to further describe the relationship between CAIX expression, VHL gene mutations and tumor characteristics. Methods: Radical nephrectomy was performed in 100 patients at 2 centers. Genomic DNA was extracted from frozen tumor samples using the QIAmp DNA mini kit. Four amplimers covering the whole coding sequence of the VHL gene were synthesized by PCR and sequenced by Big Dye. Mutation bearing sequences were confirmed by a second round of sequencing. The monoclonal antibody M75 was used to score the expression of the CAIX protein. Life table, Kaplan-Meier and Cox regression analyses addressed RCC-specific mortality (RCC-SM). Results: VHL mutations were identified in 58 patients (58%) and CAIX tumor expression ranged from 0% to 100%. Low CAIX expression (<85%) was associated with absence of VHL mutation (p=0.02), larger tumors (p=0.002), higher T stage (p=0.007), nodal metastases (p=0.001) and higher Fuhrman grade (p=0.006). Absence of VHL mutation was associated with worse ECOG (p=0.005), higher T stage (p=0.01) and presence of nodal (p=0.03) and distant metastases (p=0.02). Categorically-coded, CAIX was a statistically significant predictor of RCC-SM (p=0.002), while VHL mutation approached statistical significance (p=0.08) and a trend was observed for worse survival when VHL was not mutated. Patients with both high CAIX and VHL mutation had better survival (95.9% 1 year and 6 year median survival) than their counterparts with low CAIX expression and absence of VHL mutation (62.9% 1 year and 1.5 year median survival) (p<0.001). In Cox regression analyses, neither CAIX (p=0.06) nor VHL (p=0.4) achieved independent predictor status, when adjusted for age, gender, TNM stage, tumor size, Fuhrman and ECOG. Conclusions: Low CAIX expression is associated with the absence of VHL mutation and aggressive tumor characteristics, and is a statistically significant predictor of poor prognosis in patients with clear cell RCC. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».