Abstract 8396: A Novel Lamin Interactor (MLIP) is Critical for Cardiac Development and its Potential Role in DCM
Notice bibliographique
Résumé
A-type lamins have been implicated in the maintenance of cellular commitment and differentiation. Mutations in the LMNA gene are associated with cardiac conduction disease and dilated cardiomyopathy (DCM) in humans. The molecular mechanisms that relate mutations in LMNA with different human diseases are poorly understood and its interactions become of prominence. Using protein:protein interaction assays against Lamin A/C we discovered a novel muscle enriched lamin interacting protein (MLIP) from human heart. MLIP (C6orf142 & 2310046A06rik) is a unique single copy gene that is an innovation of amniotes (reptiles, birds and mammals). The MLIP gene encodes alternatively spliced protein variants (23 to 57kDa) that possess several novel structural motifs not found in other proteins. Like Lamin A/C, MLIP is ubiquitously expressed with tissue specific isoforms found most abundantly in heart, skeletal and smooth muscle. MLIP interacts directly and co-localizes with Lamin A and C in the nuclear envelope. Down-regulation of Lamin A/C expression by shRNA results in the up-regulation and mis-localization of MLIP. In the developing mouse heart MLIP is differentially expressed from E9 to adulthood. Conditional MLIP homozygous null mice die in utero , while hemizygous MLIP null mice develop DCM by 8 weeks of age (Table 1). Ongoing longitudinal studies combining echo with microSPECT-CT will further define the DCM phenotype. In addition to interacting with Lamin, MLIP also binds to genomic DNA within close proximity of genes encoding transcription factors (including Foxc1/c2, Foxa2, Gata4, Mef2c, Pitx2, Rxra and Tbx2) as determined by chromatin immmunoprecipitation and gel mobility shift assays. In conclusion, MLIP is a newly discovered lamin interacting protein that may serve as a tanscriptional regulator that impact genes involved in cardiac development and provides a new direction to study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».