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Enregistrement W2232246505 · doi:10.1161/circ.124.suppl_21.a8396

Abstract 8396: A Novel Lamin Interactor (MLIP) is Critical for Cardiac Development and its Potential Role in DCM

2011· article· en· W2232246505 sur OpenAlexaff
Patrick G. Burgon, Julia Lockwood, R. Glenn Wells, Elmira Ahmady, Alexandre Blais, Alexandre F.R. Stewart

Notice bibliographique

RevueCirculation · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensCanadian Heart Research CentreUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInteractorMedicineLaminComputational biologyCell biologyCardiologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A-type lamins have been implicated in the maintenance of cellular commitment and differentiation. Mutations in the LMNA gene are associated with cardiac conduction disease and dilated cardiomyopathy (DCM) in humans. The molecular mechanisms that relate mutations in LMNA with different human diseases are poorly understood and its interactions become of prominence. Using protein:protein interaction assays against Lamin A/C we discovered a novel muscle enriched lamin interacting protein (MLIP) from human heart. MLIP (C6orf142 & 2310046A06rik) is a unique single copy gene that is an innovation of amniotes (reptiles, birds and mammals). The MLIP gene encodes alternatively spliced protein variants (23 to 57kDa) that possess several novel structural motifs not found in other proteins. Like Lamin A/C, MLIP is ubiquitously expressed with tissue specific isoforms found most abundantly in heart, skeletal and smooth muscle. MLIP interacts directly and co-localizes with Lamin A and C in the nuclear envelope. Down-regulation of Lamin A/C expression by shRNA results in the up-regulation and mis-localization of MLIP. In the developing mouse heart MLIP is differentially expressed from E9 to adulthood. Conditional MLIP homozygous null mice die in utero , while hemizygous MLIP null mice develop DCM by 8 weeks of age (Table 1). Ongoing longitudinal studies combining echo with microSPECT-CT will further define the DCM phenotype. In addition to interacting with Lamin, MLIP also binds to genomic DNA within close proximity of genes encoding transcription factors (including Foxc1/c2, Foxa2, Gata4, Mef2c, Pitx2, Rxra and Tbx2) as determined by chromatin immmunoprecipitation and gel mobility shift assays. In conclusion, MLIP is a newly discovered lamin interacting protein that may serve as a tanscriptional regulator that impact genes involved in cardiac development and provides a new direction to study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,025

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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