A proposal for cellularity assessment for EGFR mutational analysis with a correlation with DNA yield and evaluation of the number of sections obtained from cell blocks for immunohistochemistry in non-small cell lung carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
AIMS: Different approaches have been described for reporting specimen adequacy for epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation analysis. We aimed: (1) to conduct cellularity assessment and to investigate its association with DNA yield, (2) to compare the H&E slides taken before and after the thick sections (curls) obtained for EGFR testing and (3) to evaluate the number of ancillary studies performed. METHODS: Cell block (CB) slides of 110 non-small cell lung carcinoma cases submitted to EGFR analysis from 2010 to 2012 were reviewed for total cellularity (ranges 1-100, 100-250, 250-500, 500-750, 750-1000 and >1000 cells), tumour cellularity (ranges 1-50, 50-100, 100-300 and >300 cells) and the percentage of tumour cells. Precurl and postcurl H&E slides were compared using the three criteria. The number of immunohistochemistry (IHC) markers and special stains and DNA yield were recorded. RESULTS: DNA yield was significantly associated with the total cellularity, number and percentage of tumour cells. For 46 cases with precurl and postcurl slides, only three (6.5%) were classified as being different and in two of them the postcurl slide had greater cellularity than the precurl. IHC was performed in 83 cases, with a minimum of 1 and a maximum of 11 markers (median of 3) per case. CONCLUSIONS: An association between the total cellularity and the tumour cellularity with the DNA yield was demonstrated using the ranges described. Evaluation of a postcurl slide is an unnecessary practice. The majority of the CB had sufficient material for ancillary studies (up to 11 markers) and mutation testing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».