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Enregistrement W2232756031 · doi:10.1093/ndt/gfv426

Use of urine biomarker-derived clusters to predict the risk of chronic kidney disease and all-cause mortality in HIV-infected women

2016· article· en· W2232756031 sur OpenAlexaff
Rebecca Scherzer, Haiqun Lin, Alison G. Abraham, Heather Thiessen‐Philbrook, Chirag R. Parikh, Michael Bennett, Mardge H. Cohen, Marek Nowicki, Deborah Gustafson, Anjali Sharma, Mary Young, Phyllis C. Tien, Vasantha Jotwani, Michael G. Shlipak

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV-related health complications and treatments
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreWestern University
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin DiseasesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Institute on Deafness and Other Communication DisordersNational Institute on Drug AbuseNational Institute of Mental HealthNational Cancer InstituteNational Institute on Alcohol Abuse and AlcoholismNational Institute on AgingNational Institutes of Health
Mots-clésMedicineKidney diseaseRenal functionCreatinineInternal medicineBiomarkerIncidence (geometry)UrineAcute kidney injuryGastroenterologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Although individual urine biomarkers are associated with chronic kidney disease (CKD) incidence and all-cause mortality in the setting of HIV infection, their combined utility for prediction remains unknown. METHODS: We measured eight urine biomarkers shown previously to be associated with incident CKD and mortality risk among 902 HIV-infected women in the Women's Interagency HIV Study: N-acetyl-β-d-glucosaminidase (NAG), kidney injury molecule-1 (KIM-1), alpha-1 microglobulin (α1m), interleukin 18, neutrophil gelatinase-associated lipocalin, albumin-to-creatinine ratio, liver fatty acid-binding protein and α-1-acid-glycoprotein. A group-based cluster method classified participants into three distinct clusters using the three most distinguishing biomarkers (NAG, KIM-1 and α1m), independent of the study outcomes. We then evaluated associations of each cluster with incident CKD (estimated glomerular filtration rate <60 mL/min/1.73 m(2) by cystatin C) and all-cause mortality, adjusting for traditional and HIV-related risk factors. RESULTS: Over 8 years of follow-up, 177 CKD events and 128 deaths occurred. The first set of clusters partitioned women into three groups, containing 301 (Cluster 1), 470 (Cluster 2) and 131 (Cluster 3) participants. The rate of CKD incidence was 13, 21 and 50% across the three clusters; mortality rates were 7.3, 13 and 34%. After multivariable adjustment, Cluster 3 remained associated with a nearly 3-fold increased risk of both CKD and mortality, relative to Cluster 1 (both P < 0.001). The addition of the multi-biomarker cluster to the multivariable model improved discrimination for CKD (c-statistic = 0.72-0.76, P = 0.0029), but only modestly for mortality (c = 0.79-0.80, P = 0.099). Clusters derived with all eight markers were no better for discrimination than the three-biomarker clusters. CONCLUSIONS: For predicting incident CKD in HIV-infected women, clusters developed from three urine-based kidney disease biomarkers were as effective as an eight-marker panel in improving risk discrimination.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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