Environmental DNA (eDNA) detection and habitat occupancy of threatened spotted gar (Lepisosteus oculatus)
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Determining the occurrence and site occupancy of rare and endangered species can be challenging, particularly without causing harm or stress to the species of concern. Environmental DNA (eDNA) detection was used to assess habitat occupancy by spotted gar ( Lepisosteus oculatus ), which is federally listed as Threatened in Canada, with known occurrences limited to a small number of locations in southern Ontario. Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) assays were developed to detect spotted gar eDNA, which was detected in all but one previously recorded location. The eDNA method was shown to be more effective than traditional netting for detecting spotted gar habitat use. The use of qPCR allowed for quantification of substantial variation in detection strength (copy number) among replicate eDNA samples, with implications for establishing sampling designs for detection and surveillance. The use of eDNA for detection and monitoring of aquatic species of conservation concern shows great potential as a non‐invasive method for assessing species occurrences and habitat occupancy, as well as for informing targeted sampling by conventional capture methods. Copyright © 2016 John Wiley & Sons, Ltd.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».