Vitamin D binding protein gene polymorphisms and chronic obstructive pulmonary disease: a meta-analysis.
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: A number of polymorphisms in vitamin D binding protein (VDBP) (GC) gene have been implicated in risk of chronic obstructive pulmonary disease (COPD), but the results were controversial. GC1F, GC1S, and GC2 are three common variants of the VDBP gene [single nucleotide polymorphisms (SNPs): rs7041 and rs4588], which were reported to be associated with COPD. This study aimed to explore the association between VDBP gene polymorphisms and COPD. METHODS: PubMed, EMBASE, Web of Science (Medline) and Chinese National Knowledge Infrastructure (CNKI) were searched for eligible case-control studies. Study quality was evaluated using the Newcastle-ottawa quality assessment scale (NOS). After the most appreciated genetic model was identified, a meta-analysis was performed to test the association between VDBP gene polymorphism and COPD. The pooled odds ratios (ORs) were performed respectively for the most appreciated genetic model, single allele comparison and homozygous gene model analysis. Summary receiver operating characteristic curve (SROC) analyses were applied to evaluate the diagnostic performance of polymorphism of VDBP to COPD. RESULTS: Eight studies containing 2,216 participants were included. The analyses of the most appropriate genetic models offered significant results in recessive model of GC1F/1S group (OR =2.18), co-dominant genetic model in GC1F/2 group (1F-1F vs. 2-2: OR =4.87; 1F-2 vs. 2-2: OR =1.73; 1F-1F vs. 1F-2: OR =2.27). In single allele comparison, significant results were obtained in GC1F vs. GC1S and GC1F vs. GC2, with ORs were 1.47 and 1.77, respectively. In homozygous genes comparison, the OR was 2.51 in GC1F homozygote vs. other genotypes. Subgroup analyses offered the same significant results in Asian population, but not in Caucasian population. The SROC analyses showed the less accurate performance of polymorphism of VDBP to COPD. CONCLUSIONS: There is a close association between COPD and GC gene polymorphisms. The GC1F allele could be a risk factor, the GC1S and GC2 allele may be protective factors in Asian, but not in Caucasians.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,011 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,014 | 0,041 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».