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Enregistrement W2237203150 · doi:10.7287/peerj.preprints.323v1

Speculation versus data-driven conclusions: A response to Gereau et al.’s "Phylogenetic patterns of extinction risk: the need for critical application of appropriate datasets"

2014· article· en· W2237203150 sur OpenAlexaff
Barnabas H. Daru, Kowiyou Yessoufou, Jonathan Davies

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSpeculationExtinction (optical mineralogy)BiodiversityPhylogenetic treeGeographyArgument (complex analysis)EcologyGenealogyData scienceEvolutionary biologyHistoryBiologyComputer scienceEconomicsPaleontology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Gereau et al. (2013) criticized our recent analysis on the phylogenetic patterns of extinction risk in the Eastern Arc biodiversity hotspot (Yessoufou et al. 2012). However, Gereau and colleagues based their critique on preconceptions and speculation rather than data. Here we identify several shortfalls in their lines of argument, and suggest that, given current rates of extinction, it is far more dangerous to wait for complete Red List assessments than to explore patterns of threat using available data. Nonetheless, we agree that all analyses should be based upon the best available data, and we encourage the rapid releases of new data on threat status for the flora of the Eastern Arc.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,307
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,538
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,307
Score d'incertitude au seuil0,854

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,3070,538
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0050,004
Bibliométrie0,0050,006
Études des sciences et des technologies0,0100,050
Communication savante0,0160,031
Science ouverte0,0150,014
Intégrité de la recherche0,0430,109
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,003

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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