The Non‐Coding Transcriptome as a Dynamic Regulator of Prostate Cancer Metastasis
Notice bibliographique
Résumé
While localized prostate cancer (PCa) is readily treated using surgery or radiotherapy, there are no curative therapeutic options available for metastatic PCa. Long non‐coding RNAs (lncRNAs) play critical roles in cancer, either as oncogenes or tumor suppressors, although the mechanisms by which they regulate tumor development and progression are still poorly understood. We utilized our unique collection of patient‐derived prostate tumor tissue xenograft models to identify lncRNAs differentially expressed in metastatic versus non‐metastatic xenografts. PCAT18 is a previously uncharacterized lncRNA specifically expressed in the prostate compared to 11 other normal tissues and up‐regulated in PCa compared to 15 other neoplasms. PCAT18 silencing significantly inhibited PCa cell proliferation, migration and invasion, and also triggered caspase 3/7 activation, with no effect on non‐neoplastic BPH1 cells. Among the lncRNAs down‐regulated in the metastatic xenograft, we focused on LOC153684, which is classified as an uncharacterized lncRNA. Higher expression of this transcript is associated with longer progression‐free survival after prostatectomy (p=0.03). In keeping with its putative onco‐suppressive role, LOC153684 is significantly down‐regulated in prostate cancer specimens, compared to normal prostatic tissue (p=0.04, average fold change ‐1.99). In addition, expression of this transcript is higher in BPH1 cells (non‐neoplastic) compared to all PCa cell lines tested. Understanding the molecular mechanisms by which these lncRNAs regulate PCa progression may facilitate the development of novel therapeutics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».