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Enregistrement W2237413578 · doi:10.3732/ajb.1500072

Vicariance, long‐distance dispersal, and regional extinction–recolonization dynamics explain the disjunct circumpolar distribution of the arctic‐alpine plant <i>Silene acaulis</i>

2015· article· en· W2237413578 sur OpenAlexaff
Galina Gussarova, Geraldine A. Allen, Yulia V. Mikhaylova, Laurie J. McCormick, Virginia Mirré, Kendrick L. Marr, Richard J. Hebda, Christian Brochmann

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensRoyal British Columbia MuseumUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBeringiaVicarianceBiological dispersalBiologyDisjunctSileneRange (aeronautics)Disjunct distributionRefugium (fishkeeping)PhylogeographyBiogeographyEcologyArcticPopulationPhylogenetic tree

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: Many arctic-alpine species have vast geographic ranges, but these may encompass substantial gaps whose origins are poorly understood. Here we address the phylogeographic history of Silene acaulis, a perennial cushion plant with a circumpolar distribution except for a large gap in Siberia. METHODS: We assessed genetic variation in a range-wide sample of 103 populations using plastid DNA (pDNA) sequences and AFLPs (amplified fragment length polymorphisms). We constructed a haplotype network and performed Bayesian phylogenetic analyses based on plastid sequences. We visualized AFLP patterns using principal coordinate analysis, identified genetic groups using the program structure, and estimated genetic diversity and rarity indices by geographic region. KEY RESULTS: The history of the main pDNA lineages was estimated to span several glaciations. AFLP data revealed a distinct division between Beringia/North America and Europe/East Greenland. These two regions shared only one of 17 pDNA haplotypes. Populations on opposite sides of the Siberian range gap (Ural Mountains and Chukotka) were genetically distinct and appear to have resulted from postglacial leading-edge colonizations. We inferred two refugia in North America (Beringia and the southern Rocky Mountains) and two in Europe (central-southern Europe and northern Europe/East Greenland). Patterns in the East Atlantic region suggested transoceanic long-distance dispersal events. CONCLUSIONS: Silene acaulis has a highly dynamic history characterized by vicariance, regional extinction, and recolonization, with persistence in at least four refugia. Long-distance dispersal explains patterns across the Atlantic Ocean, but we found no evidence of dispersal across the Siberian range gap.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,256

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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