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Enregistrement W2238514531 · doi:10.1126/science.aac9396

De novo mutations in congenital heart disease with neurodevelopmental and other congenital anomalies

2015· article· en· W2238514531 sur OpenAlexafffund
Jason Homsy, Samir Zaidi, Yufeng Shen, James S. Ware, Kaitlin E. Samocha, Konrad J. Karczewski, Steven R. DePalma, David McKean, Hiroko Wakimoto, Josh Gorham, Sheng Chih Jin, John Deanfield, Anna Giardini, George A. Porter, Richard Kim, Kaya Bilgüvar, Francesc López‐Giráldez, Irina Tikhonova, Shrikant Mane, Angela Romano-Adesman, Hongjian Qi, Badri N. Vardarajan, Lijiang Ma, Mark J. Daly, Amy E. Roberts, Mark W. Russell, Seema Mital, Jane W. Newburger, J. William Gaynor, Roger E. Breitbart, Ivan Iossifov, Michael Ronemus, Stephan Sanders, Jonathan R. Kaltman, Jonathan G. Seidman, Martina Brueckner, Bruce D. Gelb, Elizabeth Goldmuntz, Richard P. Lifton, Christine E. Seidman, Wendy K. Chung

Notice bibliographique

RevueScience · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCongenital Heart Disease Studies
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFondation LeducqArthritis Research UKNational Heart, Lung, and Blood InstituteHeart and Stroke Foundation of CanadaNational Institute of General Medical SciencesNational Institute for Health and Care ResearchHarvard Medical SchoolAcademy of Medical SciencesBritish Heart FoundationWellcome TrustImperial College LondonWellcomeSimons FoundationMedical Research CouncilVersus ArthritisHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésHeart diseaseExome sequencingMedicineNeurodevelopmental disorderPediatricsDiseaseGenotypingExomeIntervention (counseling)Intellectual disabilityMutationGeneticsGeneInternal medicineBiologyGenotypePsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital heart disease (CHD) patients have an increased prevalence of extracardiac congenital anomalies (CAs) and risk of neurodevelopmental disabilities (NDDs). Exome sequencing of 1213 CHD parent-offspring trios identified an excess of protein-damaging de novo mutations, especially in genes highly expressed in the developing heart and brain. These mutations accounted for 20% of patients with CHD, NDD, and CA but only 2% of patients with isolated CHD. Mutations altered genes involved in morphogenesis, chromatin modification, and transcriptional regulation, including multiple mutations in RBFOX2, a regulator of mRNA splicing. Genes mutated in other cohorts examined for NDD were enriched in CHD cases, particularly those with coexisting NDD. These findings reveal shared genetic contributions to CHD, NDD, and CA and provide opportunities for improved prognostic assessment and early therapeutic intervention in CHD patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations888
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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