Independent validation of a genomic classifier in an at-risk population of men conservatively managed after radical prostatectomy.
Notice bibliographique
Résumé
16 Background: Patients with locally advanced prostate cancer after radical prostatectomy (RP) are at risk for clinical progression and by current guidelines are candidates for adjuvant radiation. While clinical trials comparing adjuvant radiation to observation demonstrated benefits for many of these patients about 50% men on the control observation arm did not progress. This study evaluated whether a validated genomic classifier ([GC], Decipher) for predicting metastasis can be used to identify high-risk patients that may be spared unnecessary secondary therapy. The objective was to validate GC predictions in an at risk population conservatively managed after RP. Methods: A case-cohort design was used to sample patients with either preop PSA>20 ng/mL, pT3, positive surgical margin or Gleason score 8 or more disease, treated at Cleveland Clinic with RP from 1987 to 2008. Patients with lymph node metastasis or neo-adjuvant or adjuvant treatment were excluded. Cases were defined as local recurrence and/or regional/distant metastasis confirmed by biopsy or positive CT/bone scan. Random sampling of the cohort, including all cases, yielded 220 patients. Tissue was available for 196 and GC scores were generated for 184 patients. AUC for survival data, weighted Cox regression analysis and cumulative incidence adjusting for competing risk were used to assess GC performance for predicting distant metastasis (DM) in comparison to the 2005 Stephenson nomogram. Results: GC had an AUC of 0.89 (95% CI 0.62-0.97) for predicting DM at 5 years post-RP. A combined GC-Stephenson model yielded an AUC of 0.81 (95% CI 0.62-0.96). GC was the predominant predictor in multivariable Cox analysis with an HR of 1.55 (95% CI 1.25-1.90) for a 10% increase in score. Patients with high (21.7%) and low GC scores (58.7%) had a 3.97 fold higher and 3.88 fold lower incidence of DM at 5 years than the intermediate group (19.6%), respectively. Conclusions: We present results of a second, blinded independent validation study of GC performance in a conservatively managed RP cohort. In an at risk population use of GC may further allow identification of men that may be safely spared adjuvant radiation therapy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».