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Enregistrement W2241662783 · doi:10.1093/ejcts/ezv190

Knowingly repeating an incorrect and inefficient analysis is flawed logic

2015· letter· en· W2241662783 sur OpenAlexaff
Gary S. Collins, Yannick Le Manach

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Cardio-Thoracic Surgery · 2015
Typeletter
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésComputer scienceBusiness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In their study, Garcia-Valentin et al. [ 1 ] evaluated the performance of EuroSCORE and EuroSCORE II in a cohort of 4034 patients undergoing cardiac surgery in Spain. While we applaud the authors for conducting this independent external validation, which is uncommon, we wish to highlight some methodological and reporting concerns so that future investigators do not replicate them. The two key components characterizing the performance of a prediction model are discrimination and calibration. Discrimination is the ability of the prediction model to differentiate between those who do and do not experience the outcome event (quantified by c -index which is equivalent to the area under the receiver operating characteristic curve). Calibration is the agreement between outcome predictions from the model and the observed outcomes. In the study by Garcia-Valentin et al. , calibration was evaluated using the Hosmer–Lemeshow test, which the authors correctly highlight as being problematic. The Hosmer–Lemeshow test has limited power to evaluate calibration, affected by sample size and grouping and gives no indication on the direction and magnitude of (mis)calibration [ 2 ]. Unfortunately, the authors disappointingly proceeded to use this test to judge calibration on the premise that this was used in the original model development study [ 3 ]. Repeating an incorrect and uninformative analysis on the grounds that it was done in the original study is flawed logic and if methodological concerns are raised, then alternative and correct analyses should be carried out. Knowingly repeating a flawed analysis even if concerns are raised, incorrectly supports and justifies its use by other investigators and the cycle is never broken. The study by Garcia-Valentin et al. raised concerns of the approach but only in the ‘Discussion’ section, which is often not read as closely as the ‘Methods’ or ‘Results’ section of a manuscript. In accordance with recent recommendations on the reporting of prediction model studies [ 2 , 4 ], calibration should be assessed graphically by plotting predicted outcome probabilities ( x -axis) against observed outcomes ( y -axis) using a high-resolution smoothed (loess) line. The direction and magnitude of any miscalibration can then be examined across the entire probability range. The calibration plot can also be supplemented with a numerical quantification of calibration by examining the calibration slope and intercept and the 0.9 quantile of the absolute prediction error [ 5 , 6 ]. We recommend investigators, peer reviewers and editors to read the recent guidance from the Transparent Reporting of a multivariable prediction model for Individual Prognosis or Diagnosis (TRIPOD) Initiative ( www.tripod-statement.org ). The TRIPOD reporting guideline for clinical prediction models, discusses key issues in the development and validation of a prediction model [ 4 ]. The TRIPOD guideline is similar to other well-known reporting guidelines (e.g. CONSORT, STROBE and PRISMA) designed to help authors, peer reviewers and journal editors in ensuring that the essential items describing the development or validation of a clinical prediction model are clearly reported. Accompanying the reporting guideline is an extensive Explanation and Elaboration article describing the rationale for the checklist item but also highlighting many methodological considerations when developing or validating a clinical prediction model [ 2 ].

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,049
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,314
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,951
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0490,314
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,006
Communication savante0,0030,004
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0110,015
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineMéthodes
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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