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Enregistrement W2241688186 · doi:10.1200/jco.2007.25.18_suppl.10555

<i>MMP1 1G/2G</i> promoter polymorphism and risk of esophageal adenocarcinoma

2007· article· en· W2241688186 sur OpenAlexaff
Shivanshu Singh, Kofi Asomaning, Matthew H. Kulke, Wei Zhou, Rihong Zhai, Li Su, Rebecca S. Heist, Thomas J. Lynch, David C. Christiani, G. Liu

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEsophageal Cancer Research and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineGenotypeMMP1Odds ratioGenotypingGastroenterologyInternal medicineAdenocarcinomaLung cancerAlleleEsophageal cancerBody mass indexOncologyCancerBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

10555 Background: The 2G allele of the MMP1 -1607 1G/2G promoter polymorphism creates an Ets binding site that leads to increased transcriptional and enzyme activity, particularly in the presence of growth factors and cytokines. This polymorphism has been associated with greater risk of cancer (e.g., renal cell, lung and oral cancers, glioblastomas) and cancer invasiveness (e.g., melanoma, cervical, lung and colorectal cancer). The aim of the current study was to evaluate the role of this MMP 1G/2G polymorphism in the risk of esophageal adenocarcinoma (EA). Methods: We evaluated 323 histologically confirmed EA cases and 464 healthy controls frequency-matched for age and gender. Genotyping of the MMP1 1G/2G promoter polymorphism involved a Taqman approach. All EAs had endoscopic evidence showing that the center of the tumors were located at or above the gastroesophageal junction. Odds Ratios (OR) were calculated using multivariate logistic regression, adjusted for age, gender, smoking status, and body-mass index (BMI) at the age of 18 years (to represent a healthy adult BMI). Results: Genotype frequencies were: 33% (1G/1G), 47% (1G/2G) & 20% (2G/2G) in controls; in cases, 26% (1G/1G), 50% (1G/2G) & 24% (2G/2G). 88% of cases were male. The MMP1 2G/2G and 1G/2G genotypes conferred a greater risk of EA, with adjusted ORs of 1.50 (95%CI=1.0–2.3) and 1.34 (95%CI=0.9–1.9), respectively, when compared with the wildtype 1G/1G genotype. The 2G allele (2G/2G + 1G/2G) conferred an adjusted OR of 1.38 (95%CI=1.0–1.9). By stage, the adjusted ORs for the 2G allele were 1.26 (95%CI=0.8–2.1), 1.45 (95%CI=0.9–2.3), & 1.54 (95%CI=0.9–2.7) for node negative, node-positive, and metastatic disease, respectively. Conclusions: The 2G allele of the MMP1 -1607 1G/2G polymorphism was associated with an increased risk of EA in this analysis. In addition, there was a non-significant trend towards conferring greater risk in the more advanced stages of EA, suggesting a possible role of this polymorphism in the invasiveness of this cancer. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,086
Tête enseignante GPT0,460
Écart entre enseignants0,374 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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