<i>MMP1 1G/2G</i> promoter polymorphism and risk of esophageal adenocarcinoma
Notice bibliographique
Résumé
10555 Background: The 2G allele of the MMP1 -1607 1G/2G promoter polymorphism creates an Ets binding site that leads to increased transcriptional and enzyme activity, particularly in the presence of growth factors and cytokines. This polymorphism has been associated with greater risk of cancer (e.g., renal cell, lung and oral cancers, glioblastomas) and cancer invasiveness (e.g., melanoma, cervical, lung and colorectal cancer). The aim of the current study was to evaluate the role of this MMP 1G/2G polymorphism in the risk of esophageal adenocarcinoma (EA). Methods: We evaluated 323 histologically confirmed EA cases and 464 healthy controls frequency-matched for age and gender. Genotyping of the MMP1 1G/2G promoter polymorphism involved a Taqman approach. All EAs had endoscopic evidence showing that the center of the tumors were located at or above the gastroesophageal junction. Odds Ratios (OR) were calculated using multivariate logistic regression, adjusted for age, gender, smoking status, and body-mass index (BMI) at the age of 18 years (to represent a healthy adult BMI). Results: Genotype frequencies were: 33% (1G/1G), 47% (1G/2G) & 20% (2G/2G) in controls; in cases, 26% (1G/1G), 50% (1G/2G) & 24% (2G/2G). 88% of cases were male. The MMP1 2G/2G and 1G/2G genotypes conferred a greater risk of EA, with adjusted ORs of 1.50 (95%CI=1.0–2.3) and 1.34 (95%CI=0.9–1.9), respectively, when compared with the wildtype 1G/1G genotype. The 2G allele (2G/2G + 1G/2G) conferred an adjusted OR of 1.38 (95%CI=1.0–1.9). By stage, the adjusted ORs for the 2G allele were 1.26 (95%CI=0.8–2.1), 1.45 (95%CI=0.9–2.3), & 1.54 (95%CI=0.9–2.7) for node negative, node-positive, and metastatic disease, respectively. Conclusions: The 2G allele of the MMP1 -1607 1G/2G polymorphism was associated with an increased risk of EA in this analysis. In addition, there was a non-significant trend towards conferring greater risk in the more advanced stages of EA, suggesting a possible role of this polymorphism in the invasiveness of this cancer. No significant financial relationships to disclose.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».