Identification and fine mapping of quantitative trait loci for backfat on bovine chromosomes 2, 5, 6, 19, 21, and 23 in a commercial line of Bos taurus1
Notice bibliographique
Résumé
Backfat thickness is one of the major quantitative traits that affects carcass quality in beef cattle. In this study, we identified and fine-mapped QTL for backfat EBV on bovine chromosomes 2, 5, 6, 19, 21, and 23 using an identical-by-descent haplotype-sharing analysis in a commercial line of Bos taurus. Eleven haplotypes were found to have significant associations with backfat EBV at the comparison-wise P-value threshold, and one at the chromosome-wise P-value threshold on bovine chromosomes 5, 6, 19, 21, and 23. On average, the 12 significant haplotypes had an effect of 0.62 SD on backfat EBV, ranging from 0.38 SD to 1.33 SD. The 12 significant haplotypes spanned nine chromosomal regions, one on chromosome 5 (65.4 to 70.0 cM), three on 6 (8.2 to 11.8 cM, 63.6 to 68.1 cM, and 81.5 to 83.0 cM), three on 19 (4.8 to 15.9 cM, 39.4 to 46.5 cM, and 65.7 to 99.5 cM), one on 21 (46.1 to 53.1 cM), and one on 23 (45.1 to 50.9 cM). Among the nine chromosomal regions, six were new QTL regions and three showed remarkable agreement with QTL regions that were previously reported. Eight of the nine QTL regions were localized to less than or close to 10 cM in genetic distance. The results provide a useful reference for further positional candidate gene research and marker-assisted selection for backfat.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».