Measuring severe lung disease in mice - a cautionary tale
Notice bibliographique
Résumé
Background: The flexiVent small animal ventilator (SCIREQ, Canada) allows measurement of detailed respiratory mechanics on animals as small as 10g. It uses the forced oscillation technique (FOT) to measure respiratory system impedence (Zrs) by applying a signal containing 19 mutually prime sinusoidal frequencies ranging from 0.25 to 19.625 Hz at the airway opening. The constant phase model (CPM) is fit to Zrs to calculate airway resistance (Raw) tissue damping (G) and tissue elastance (H). The default settings of flexiVent apply an unweighted (absolute) fitting of the CPM to the Zrs spectra. This may not be appropriate for mice with severe lung disease. Methods: Adult female BALB/c mice with influenza-induced lung disease were challenged with methacholine (MCh). Data were analysed using the default primewave settings of flexiVent v5.1. These same data were then adjusted to remove the two lowest frequencies (0.25 and 0.625 Hz) and a relative (weighted) fitting of the CPM was applied. Results: The default analysis produced a poor model fit and uninterpretable measurements of Raw, G and H, especially at higher MCh concentrations.Applying the weighted fitting improved the application of the CPM to Zrs spectra. A better partitioning of the CPM into airway and tissue compartments was achieved by removing the lowest two frequencies from the analysis. Conclusion: The default flexiVent settings provided by SCIREQ are not suitable for accurate measurement of lung mechanics in mouse models of severelung disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,006 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,012 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,007 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».