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Enregistrement W2243635794 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e15112

Downregulation of RIZ1 protein expression in left-sided versus right-sided primary colorectal carcinomas and their distant metastases and the association with NF-B activation

2009· article· en· W2243635794 sur OpenAlexaff
Emina Torlakovic, Esmeralda Celia Marginean, Goran Torlakovic, Ron Geyer, Heather Neufeld, John F. DeCoteau

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of SaskatchewanOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineColorectal cancerImmunostainingImmunohistochemistryDownregulation and upregulationCancer researchCancerPrimary tumorApoptosisPathologyOncologyInternal medicineMetastasisBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e15112 Background: Activation of NF- B leads to enhanced proliferation and the expression of anti-apoptotic proteins, which are cancer phenotypes. RIZ1 inactivation through various molecular events was linked to increased proliferation, migration induction and apoptosis inhibition in human cancer. RIZ1 frameshift mutations were recently reported to be confined to MSI-H colorectal tumors and proximal tumor origin, while its hypermethylation was not limited to MSI-H tumors. However, RIZ1 protein expression has not been evaluated in colorectal carcinoma. Methods: TMAs included 28 left-sided and 12 right-sided primary colorectal adenocarcinomas, their matched normal mucosa and their respective distant metastases. Left-sided tumors were compared to right-sided tumors for expression of RIZ1 protein and NF- B activation. RIZ1 immunostaining was scored semiquantitatively (0–3+). NF- B activation was determined by IHC detecting nuclear translocation of its p65 subunit in more than 30% tumor nuclei. Discrepant results were defined as score difference of 2. Results: RIZ1 was less expressed in tumors than in benign mucosa (p<0.0001, r=- 0.377, Chi-Square). The difference between primary vs. metastatic carcinoma was not significant. Low RIZ1 was associated with NF- B activation (p<0.0001, Linear-by-Linear). Left-sided primary tumors showed less RIZ1 protein expression than right-sided (p=0.03, Chi-Square). NF- B activation was more frequent in left-sided primary tumors and their respective metastases (35% in right vs. 67% in left; p=0.002, Chi-Square Test). RIZ1 expression and NF- B activation were almost identical in primary and their respective metastatic tumors with only 3 discrepant results for NF- B status and 2 discrepant results in RIZ1 expression. Conclusions: While RIZ1 downregulation in colorectal adenocarcinoma due to RIZ1 mutations appears to be associated with MSI-H and proximal origin, its protein expression appears to be downregulated more often in distal tumors. NF- B activation is strongly associated with lower RIZ1 protein expression in colorectal adenocarcinoma. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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