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Enregistrement W2244231579

Restoring DF508-CFTR trafficking and activity with epigenetic modifiers

2009· article· en· W2244231579 sur OpenAlexaboutno aff
Darren M. Hutt, DM Herman, AP Rodrigues, Sabrina Noël, Martina Gentzsch

Notice bibliographique

RevueDigital Access to Libraries (Université catholique de Louvain (UCL), l'Université de Namur (UNamur) and the Université Saint-Louis (USL-B)) · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésΔF508Small hairpin RNACystic fibrosisGene knockdownMedicineDrug discoveryRNA interferenceCancer researchCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorCell cultureMolecular biologyCell biologyBiologyBioinformaticsGeneticsGeneInternal medicineRNA
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cystic fibrosis (CF) is an early onset disease characterized by a defect in the apical chloride channel, cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). The most common disease causing mutation is a 3 basepair deletion resulting in loss of Phe 508 (ΔF508), which leads to misfolding and efficient endoplasmic reticulum associated degradation (ERAD) of the protein, a hallmark of misfolding diseases. Recently epigenetic modifiers have been shown to alleviate various misfolding diseases suggesting that they may be beneficial for correcting the trafficking defect associated with the ΔF508 mutation of CFTR. We now show that treatment with such epigenetic modifiers can alleviate the ER retention of ΔF508-CFTR to deliver a functional channel to the cell surface in both a culture model (CFBE41o-) and in human primary bronchial epithelial cells isolated from CF patients homozygous for the ΔF508 mutation. Additionally we have identified a single member of a large family of enzymes as the key molecular target of these small molecule epigenetic modifiers. siRNA-mediated knockdown of this protein results in robust correction of the trafficking defect and robust cell surface chloride channel activity. We believe that this correction is a result of an overall alteration of the proteostatic environment of the cell such that multiple CFTR linked pathways are altered to favor increased ER stability, ER export, cell surface delivery and channel activity. DMHutt is supported by fellowships from the Canadian Institutes for Health Research and the Canadian Cystic Fibrosis Foundation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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