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Enregistrement W2244479535 · doi:10.3835/plantgenome2014.12.0090

Genomic Prediction of Biomass Yield in Two Selection Cycles of a Tetraploid Alfalfa Breeding Population

2015· article· en· W2244479535 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueThe Plant Genome · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGenetic gainPopulationSelection (genetic algorithm)Genomic selectionBiomass (ecology)AgronomyBiotechnologyGenetic variationSingle-nucleotide polymorphismGenotypeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alfalfa (Medicago sativa L.) is a widely planted perennial forage legume grown throughout temperate and dry subtropical regions in the world. Long breeding cycles limit genetic improvement of alfalfa, particularly for complex traits such as biomass yield. Genomic selection (GS), based on predicted breeding values obtained using genome-wide molecular markers, could enhance breeding efficiency in terms of gain per unit time and cost. In this study, we genotyped tetraploid alfalfa plants that had previously been evaluated for yield during two cycles of phenotypic selection using genotyping-by-sequencing (GBS). We then developed prediction equations using yield data from three locations. Approximately 10,000 single nucleotide polymorphism (SNP) markers were used for GS modeling. The genomic prediction accuracy of total biomass yield ranged from 0.34 to 0.51 for the Cycle 0 population and from 0.21 to 0.66 for the Cycle 1 population, depending on the location. The GS model developed using Cycle 0 as the training population in predicting total biomass yield in Cycle 1 resulted in accuracies up to 0.40. Both genotype × environment interaction and the number of harvests and years used to generate yield phenotypes had effects on prediction accuracy across generations and locations, Based on our results, the selection efficiency per unit time for GS is higher than phenotypic selection, although accuracies will likely decline across multiple selection cycles. This study provided evidence that GS can accelerate genetic gain in alfalfa for biomass yield.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,835
Score d'incertitude au seuil0,267

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle