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Enregistrement W2245508903 · doi:10.1371/journal.pone.0124117

Quantitative Trait Loci and Candidate Genes for Neutrophil Recruitment in Sterile Inflammation Mapped in AXB-BXA Recombinant Inbred Mice

2015· article· en· W2245508903 sur OpenAlexafffund
Quyen Cheng, Ze’ev Seltzer, Corneliu Sima, Flavia Lakschevitz, Michael Glogauer

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSignaling Pathways in Disease
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésQuantitative trait locusBiologyCandidate geneInbred strainGeneInflammationGeneticsMolecular biologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neutrophil recruitment (NR) to sites of sterile inflammation plays a key role in tissue damage and healing potential of lesions characteristic to non-infectious inflammatory diseases. Previous studies suggested significant genetic control of neutrophil survival, function, and migration in inflammatory responses to endogenous and exogenous stimuli. We have mapped the murine genome for quantitative trait loci (QTLs) harbouring genetic determinants that regulate NR in SI using a murine model of chemically-induced peritonitis. NR was quantified in 16 AXB-BXA recombinant inbred strains and their progenitors, A/J (A) and C57BL/6J (B). A continuous distribution of NR was found among the strains, with parent B showing higher NR and parent A showing lower NR (3.0-fold difference, p=0.05). Within the progeny strains, a 5.5-fold difference in NR was observed between the lowest, BXA1, and the highest responders AXB19 (p<0.001). This data was analyzed using GeneNetwork, which linked NR to one significant QTL on chromosome 12 (Peritoneal Neutrophil Recruitment 1, PNR1) and two suggestive QTLs (PNR2, PNR3) on chromosomes 12 and 16 respectively. Sixty-four candidate genes within PNR1 were cross-referenced with currently published data, mRNA expression from two NR microarrays, and single nucleotide polymorphism analysis. The present study brings new light into the genetics of NR in response to cell injury and highlights potential candidate genes Hif1α, Fntb, and Prkch and their products for further studies on neutrophil infiltration and inflammation resolution in sterile inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,142
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,158 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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