MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2245519076 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e16104

Characterization of lymphoid infiltrates in prostatectomy specimens post neoadjuvant hormonal therapy using quantitative immunofluorescence and RNA FISH

2009· article· en· W2245519076 sur OpenAlexaff
M. J. Donovan, F.A. Khan, D. Powell, Paola Capodieci, M.E. Gleave, Ian W. Taylor, Jesús Gómez-Navarro, Carlos Cordon‐Cardo

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunotherapy and Immune Responses
Établissements canadiensVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineFOXP3Prostate cancerImmune systemHormonal therapyPopulationOncologyCD8ProstateProstatectomyMultiplexCancerPathologyCancer researchInternal medicineImmunologyBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e16104 Background: Immunotherapy for advanced prostate cancer requires an understanding of the host response including lymphocyte subsets and cytokine expression. Using quantitative immunofluorescence (IF), image analysis and RNA FISH we examined a series of prostatectomy specimens from patients, ± neoadvjuvant hormonal therapy (NHT) and determined their baseline immune characteristics. Methods: CD4,8,25,45,68,69,86 and Foxp3 were evaluated by IF and IFNg with RNA FISH on prostatectomy specimens from 40 patients with T1c-T3 prostate cancer; 20 control and 20 post long-term NHT. Sections were analyzed with three multiplex IF assays, triplicate images acquired with spectral imaging, digitally masked and processed with IF image analysis software. IFNg RNA transcript localization was performed on all 40 patients using published protocols. Results: There was a predominance of CD8 in both control and NHT patients with a high but variable level of CD86 and 69 across the entire cohort, reflecting T cell activation. CD68 appeared reduced in NHT, but this change was not statistically significant. Number of Treg (CD4+/CD25+/Foxp3+) cells were similar between groups; however, in NHT an increased Treg population was associated with an elevated preoperative PSA compared with controls (p<0.05). IFNg transcript activity was low in the entire cohort and limited to tumor epithelial cells. Conclusions: The prominent CD8 expression and low level of IFNg in both control and NHT groups suggest an ongoing but not overly active immune response. Multiplex IF and in situ RNA FISH are useful tools for developing a disease phenotype and provide the necessary parameters for evaluating gene-protein expression especially in pharmacodynamic studies. [Table: see text]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,071
Tête enseignante GPT0,391
Écart entre enseignants0,320 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Clinical Oncology→Même sujetImmunotherapy and Immune Responses→Travaux en français237 207→