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Enregistrement W2248932904 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e12006

HER-2 gene amplification in circulating tumor cells (CTCs): Concordance with amplification status in primary breast cancers and metastatic lesions

2009· article· en· W2248932904 sur OpenAlexaff
Rinat Yerushalmi, Moshe Mishaeli, David G. Huntsman, Karen A. Gelmon

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCirculating tumor cellMedicineConcordanceMetastatic breast cancerBreast cancerDAPICancerPrimary tumorPathologyOncologyFish <Actinopterygii>ImmunohistochemistryGene duplicationLiquid biopsyInternal medicineMetastasisStainingGeneBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e12006 Background: Recent studies have suggested a significant incidence (10%-30%) of discordance in HER-2 expression between metastatic lesions and the primary breast cancer (BC) which can result in inappropriate treatment recommendations. Biopsies of recurrent BC can aid in determining the expression but are often painful, costly, or cause delays in therapy. We initiated a study with the objective to determine and compare the molecular characteristics of the primary tumor, CTCs and metastases to assess whether the assessment of HER-2 gene amplification status in CTCs by FISH analysis could be used to determine treatment. Methods: After consent, patients with metastatic BC were enrolled, peripheral blood was collected (5 cc-10 cc), metastases were biopsied and HER-2 expression was determined. Blood samples were used for the CTC assay. We performed the CTC enrichment assay using a combination of anti CK and anti-EpCAM. The criteria for CTCs were: positive for cytokeratins 8, 18, 19, positive for DAPI and negative for CD45. Slides were scanned for CTCs using the Ariol system. When a CTC was identified the slide was reused for HER-2 FISH staining using the PathVysion HER-2 DNA Probe Kit. Initial attempts of FISH on CTCs took 48 hours to complete; to hasten the process, the second scan for FISH was done only on selected areas and the images for CTCs and FISH analysis were fused to obtain FISH images on a specific CTCs resulting in a 1 hour process. Results: To date 58 samples were collected, 40 of which had CTCs. At present, biopsies are being assessed and compared to the primary lesion in the initial 20 cases. Conclusions: FISH analysis of CTCs is a feasible technique and may be used to assess the specific molecular characteristics of breast cancer. Whether their HER-2 status reflects the metastatic or primary tumor is still unclear but is being determined and may have useful clinical application. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,156
Tête enseignante GPT0,484
Écart entre enseignants0,328 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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