MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2249070556 · doi:10.1371/journal.pone.0134003

All-Trans Retinoic Acid Induces TGF-β2 in Intestinal Epithelial Cells via RhoA- and p38α MAPK-Mediated Activation of the Transcription Factor ATF2

2015· article· en· W2249070556 sur OpenAlexaff
Kopperuncholan Namachivayam, Krishnan MohanKumar, D. Arbach, Ramasamy Jagadeeswaran, Sunil K. Jain, Viswanathan Natarajan, Dolly Mehta, Robert P. Jankov, Akhil Maheshwari

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinoids in leukemia and cellular processes
Établissements canadiensUniversity of TorontoHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésRHOARetinoic acidMolecular biologyMAPK/ERK pathwayTransforming growth factorBiologyActivating transcription factor 2TretinoinSignal transductionChromatin immunoprecipitationp38 mitogen-activated protein kinasesCancer researchCell biologyChemistryGene expressionPromoterCell cultureBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: We have shown previously that preterm infants are at risk of necrotizing enterocolitis (NEC), an inflammatory bowel necrosis typically seen in infants born prior to 32 weeks' gestation, because of the developmental deficiency of transforming growth factor (TGF)-β2 in the intestine. The present study was designed to investigate all-trans retinoic acid (atRA) as an inducer of TGF-β2 in intestinal epithelial cells (IECs) and to elucidate the involved signaling mechanisms. METHODS: AtRA effects on intestinal epithelium were investigated using IEC6 cells. TGF-β2 expression was measured using reverse transcriptase-quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) and Western blots. Signaling pathways were investigated using Western blots, transiently-transfected/transduced cells, kinase arrays, chromatin immunoprecipitation, and selective small molecule inhibitors. RESULTS: AtRA-treatment of IEC6 cells selectively increased TGF-β2 mRNA and protein expression in a time- and dose-dependent fashion, and increased the activity of the TGF-β2 promoter. AtRA effects were mediated via RhoA GTPase, Rho-associated, coiled-coil-containing protein kinase 1 (ROCK1), p38α MAPK, and activating transcription factor (ATF)-2. AtRA increased phospho-ATF2 binding to the TGF-β2 promoter and increased histone H2B acetylation in the TGF-β2 nucleosome, which is typically associated with transcriptional activation. CONCLUSIONS: AtRA induces TGF-β2 expression in IECs via RhoA- and p38α MAPK-mediated activation of the transcription factor ATF2. Further studies are needed to investigate the role of atRA as a protective/therapeutic agent in gut mucosal inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,455

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetRetinoids in leukemia and cellular processesTravaux en français237 207