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Enregistrement W2249501726 · doi:10.1200/jco.2009.27.15_suppl.e22066

Molecular changes in epidermal growth factor receptor (EGFR) in non-small cell lung cancer (NSCLC) biopsies at time of progression compared to initial biopsy

2009· article· en· W2249501726 sur OpenAlexaff
G. Speranza, V. Cohen, Jason Agulnik, George Chong, F. Meilleur, Guilherme Brandao, Goulnar Kasymjanova, David Small, Wilson H. Miller

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Oncology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLung cancerExonMedicineEpidermal growth factor receptorMissense mutationBiopsyLiquid biopsyOncologyT790MMutationPathologyCancer researchInternal medicineCancerGeneGefitinibBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

e22066 Background: EGFR mutations predict sensitivity and clinical outcome to tyrosine kinase inhibitors (TKI) in NSCLC. The two most commonly described mutations are Exon 19 deletion and Exon 21 L858R missense mutations. Genetic alterations over time have been described in other tumour types, but studies assessing EGFR genotypic changes with lung cancer progression are lacking. We sought to compare EGFR mutational status from lung tumors at time of recurrence or progression with the primary tumor. Methods: Using the Jewish General Hospital lung cancer database, of all patients diagnosed with NSCLC since 1999, those with biopsies at two different points in time were identified. All tumour samples were genotyped for EGFR exons 19 and 21 mutations using denaturing high performance liquid chromatography (dHPLC). Results: 29 patients were identified. Data for 12 patients, whose time of recurrence or progression varied between 4 months and 6 years, are available at this time. Of 12 patients, one had EGFR exon 19 mutation at time of diagnosis. One patient who initially displayed no EGFR mutation was found to have an exon 19 deletion at time of recurrence. The one with exon 19 at time of initial diagnosis continued to express exon 19 in the second biopsy. Conclusions: To our knowledge, this is the only study assessing changes in molecular genotype using dHPLC between primary and recurrent or progressive lung cancer biopsy specimens. Although sample size is small, it is evident that changes in EGFR mutational status can occur. Further prospective studies are required to determine how commonly molecular changes occur. No significant financial relationships to disclose.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,058
Tête enseignante GPT0,473
Écart entre enseignants0,415 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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