Correlation between Nottingham grade and Oncotype DX score in breast cancer: Implications for cost-effective incorporation of oncotype in the clinic.
Notice bibliographique
Résumé
106 Background: Nottingham grading (NG) for breast cancer uses tubule formation (TF), nuclear polymorphism (NP), and mitotic count (MC). The Oncotype Dx recurrence score (RS) is a 21-gene assay that predicts recurrence. Both NG and RS can influence decisions about the use of adjuvant chemotherapy in patients with ER+, HER2-, T1-T2, N0 cancers. The objective was to determine the correlation of overall NG, TF, NP, MC with RS risk group in such patients. This may be useful in guiding the use of Oncotype in specific cases. Methods: 231 patients referred to the BC Cancer Agency between 2007-2011 with ER+, HER2-, T1-T2, N0 breast cancer and an Oncotype were identified. Histologic grading was assessed on the specimen used for Oncotype. Spearman’s correlation coefficients, and 95% confidence intervals (CI) were calculated for the RS risk group versus overall NG, TF, NP, and MC. This study adds to the literature as it is one of the largest cohorts examining this topic and focuses on a HER2- patient population. Results: There was a significant positive moderate correlation between RS and overall grade (Spearman coefficient 0.47, [95%CI: 0.36, 0.56])(Table 1), and RS and MC (Spearman 0.44, [95%CI: 0.33, 0.54]). There was a significant positive weak correlation between RS and TF (Spearman 0.25, [95%CI: 0.13, 0.37]) and RS and NP (Spearman 0.34, [95%CI: 0.22, 0.45]). None of the patients with low overall NG had a high risk RS. Conclusions: Patients with a low NG are unlikely to have a high risk RS (0 in 231 patients) and very few such patients would benefit from the expense of an Oncotype. Overall NG has a better correlation with RS than TF, MC, or NP components alone. [Table: see text]
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,017 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».