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Enregistrement W2252942951 · doi:10.1111/jam.13050

Bacterial endophytes from wild and ancient maize are able to suppress the fungal pathogen <i>Sclerotinia homoeocarpa</i>

2016· article· en· W2252942951 sur OpenAlexafffund
Hanan R. Shehata, E.M. Lyons, K.S. Jordan, Manish N. Raizada

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesAgricultural Adaptation Council
Mots-clésBiologyEndophytePathogenSclerotinia sclerotiorumBotanyPlant use of endophytic fungi in defenseBurkholderiaAntibiosisMicrobiologyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: The aim of this study was to determine if endophytes from wild and ancient Zea plants (corn family) have anti-fungal activities, specifically against the most important fungal pathogen (Sclerotinia homoeocarpa) of creeping bentgrass, a relative of Zea, used here as a model grass. METHODS AND RESULTS: A library of 190 bacterial endophytes from wild, ancient and modern Zea plants were tested for their ability to suppress S. homoeocarpa in vitro, followed by in planta testing of candidates using greenhouse trials. Three endophytes could suppress S. homoeocarpa, originating from wild maize and an ancient Mexican landrace, consistent with our hypothesis. 16S phylogenetic analysis and BOX-PCR DNA fingerprinting suggest that the anti-fungal endophytes are distinct strains of Burkholderia gladioli. One strain (3A12) was confirmed to colonize creeping bentgrass using green fluorescent protein (GFP) tagging. Evans blue vitality staining demonstrated that the bacterial endophytes exhibited fungicidal activities against the pathogen. The endophytes inhibited a wide spectrum of plant-associated fungi including diverse crop pathogens. CONCLUSIONS: The results support the hypothesis that wild and ancient Zea genotypes host bacterial endophytes that can control fungal pathogen(s). SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: These results suggest that wild and ancient crops may be an unexplored reservoir of anti-fungal bacterial endophytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,166
Écart entre enseignants0,157 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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