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Enregistrement W2254077104 · doi:10.1002/em.21994

Exposure to persistent organic pollutants and sperm <scp>DNA</scp> methylation changes in Arctic and European populations

2016· article· en· W2254077104 sur OpenAlexaboutno aff
Claudia Consales, Gunnar Toft, Giorgio Leter, Jens Peter Bonde, Raffaella Uccelli, Francesca Pacchierotti, Patrizia Eleuteri, Bo Jönsson, Aleksander Giwercman, Henning Sloth Pedersen, Paweł Struciński, Katarzyna Góralczyk, Valentyna Zviezdai, Marcello Spanò

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDNA methylationPollutantSpermMethylationDNABiologyArcticGeneticsThe arcticEcologyGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Persistent organic pollutants (POPs), such as PCBs (polychlorinated biphenyls) and DDT [1,1,1-trichloro-2,2-bis(4-chlorophenyl)ethane], are environmental contaminants with potential endocrine disrupting activity. DNA methylation levels in peripheral blood lymphocytes have been associated with serum concentrations of POPs in Greenland Inuit and Korean populations. Greenland Inuits are characterized by the highest worldwide POP levels. In this cross-sectional study we evaluated the relationship between serum POP concentrations and DNA methylation levels in sperm of non-occupationally exposed fertile men from Greenland, Warsaw (Poland), and Kharkiv (Ukraine). Serum levels of PCB-153 [1,2,4-trichloro-5-(2,4,5-trichlorophenyl)benzene], as a proxy of the total PCBs body burden, and of p,p'-DDE [1,1-dichloro-2,2-bis(4-chlorophenyl)ethylene], the main metabolite of DDT were measured. Sperm DNA methylation level was assessed globally by flow cytometric (FCM) immunodetection of 5-methyl-cytosines and at specific repetitive DNA sequences (Alu, LINE-1, Satα) by PCR-pyrosequencing after bisulfite conversion. Multivariate linear regression analysis was applied to investigate correlations between serum POP concentrations and DNA methylation. No consistent associations between exposure to POPs and sperm DNA methylation at repetitive DNA sequences were detected. A statistically significant global decrease in methylation was associated with exposure to either POP by FCM analysis. This is the first study to investigate environmental exposure to POPs and DNA methylation levels considering sperm as the target cells. Although POP exposure appears to have a limited negative impact on sperm DNA methylation levels in adult males, the global hypomethylation detected by one of the methods applied suggests that further investigation is warranted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,045

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations45
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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