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What's in a genome? The C-value enigma and the evolution of eukaryotic genome content

2015· article· en· 333 citations· W2254186441 sur OpenAlex· 10.1098/rstb.2014.0331

Pourquoi ce travail est-il dans la base ?

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

Affiliation canadienneUne personne signataire a déclaré un établissement canadien. C'est la seule voie dont dispose la base habituelle.
Organisme subventionnaire canadienUn organisme canadien l'a financé. Le travail peut ne porter aucune affiliation canadienne.

Prédiction distillée sur la base complète

Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

Catégories candidates
Études des sciences et des technologies
Catégories consensuelles
aucune
Domaine
Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
Devis d'étude
Signal candidat: ObservationnelSignal consensuel: aucune
Genre
Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants
0,579
Score d'incertitude au seuil
0,999
Statut de validation
machine_predicted_unvalidated · codex-gemma-dda1882f352a

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Tête enseignante Opus0,059
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants
0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Résumé

Some notable exceptions aside, eukaryotic genomes are distinguished from those of Bacteria and Archaea in a number of ways, including chromosome structure and number, repetitive DNA content, and the presence of introns in protein-coding regions. One of the most notable differences between eukaryotic and prokaryotic genomes is in size. Unlike their prokaryotic counterparts, eukaryotes exhibit enormous (more than 60,000-fold) variability in genome size which is not explained by differences in gene number. Genome size is known to correlate with cell size and division rate, and by extension with numerous organism-level traits such as metabolism, developmental rate or body size. Less well described are the relationships between genome size and other properties of the genome, such as gene content, transposable element content, base pair composition and related features. The rapid expansion of 'complete' genome sequencing projects has, for the first time, made it possible to examine these relationships across a wide range of eukaryotes in order to shed new light on the causes and correlates of genome size diversity. This study presents the results of phylogenetically informed comparisons of genome data for more than 500 species of eukaryotes. Several relationships are described between genome size and other genomic parameters, and some recommendations are presented for how these insights can be extended even more broadly in the future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

La notice

Revue
Philosophical Transactions of the Royal Society B Biological Sciences
Thématique
Genomics and Phylogenetic Studies
Domaine
Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
Établissements canadiens
University of Guelph
Organismes subventionnaires
Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clés
GenomeGenome sizeBiologyTransposable elementGenome evolutionGC-contentGeneticsGeneEukaryotic chromosome fine structureGene densityBacterial genome sizeEvolutionary biologyArchaea
Résumé présent dans OpenAlex
oui