Relationships among injury, fibrosis, and time in human kidney transplants
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Kidney transplant biopsies offer an opportunity to understand the pathogenesis of organ fibrosis. We studied the relationships between the time of biopsy after transplant (TxBx), histologic fibrosis, diseases, and transcript expression. METHODS: = 399, >1 year) after transplant were used to analyze the molecular landscape of fibrosis in relationship to histologic fibrosis and diseases. RESULTS: Fibrosis was absent at transplantation but was present in some early biopsies by 4 months after transplant, apparently as a self-limited response to donation implantation injury not associated with progression to failure. The molecular phenotype of early biopsies represented the time sequence of the response to wounding: immediate expression of acute kidney injury transcripts, followed by fibrillar collagen transcripts after several weeks, then by the appearance of immunoglobulin and mast cell transcripts after several months as fibrosis appeared. Fibrosis in late biopsies correlated with injury, fibrillar collagen, immunoglobulin, and mast cell transcripts, but these were independent of time. Pathway analysis revealed epithelial response-to-wounding pathways such as Wnt/β-catenin. CONCLUSION: Fibrosis in late biopsies had different associations because many kidneys had potentially progressive diseases and subsequently failed. Molecular correlations with fibrosis in late biopsies were independent of time, probably because ongoing injury obscured the response-to-wounding time sequence. The results indicate that fibrosis in kidney transplants is driven by nephron injury and that progression to failure reflects continuing injury, not autonomous fibrogenesis. TRIAL REGISTRATION: INTERCOM study (www.clinicalTrials.gov; NCT01299168). FUNDING: Canada Foundation for Innovation and Genome Canada.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».