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Enregistrement W2255352445 · doi:10.3892/ol.2016.4209

Development of a standardized flow cytometric method to conduct longitudinal analyses of intracellular CD3ζ expression in patients with head and neck cancer

2016· article· en· W2255352445 sur OpenAlexafffund
Deepak Upreti, Alok Pathak, Sam K. P. Kung

Notice bibliographique

RevueOncology Letters · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Cell Function and Interaction
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesManitoba Medical Service Foundation
Mots-clésOncogeneCancerCell cycleFlow cytometryMolecular medicineIntracellularHead and neckBiologyHead and neck cancerExpression (computer science)PathologyOncologyMedicineCancer researchInternal medicineCell biologyMolecular biologySurgeryComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the sixth most common neoplasm in the world. The follow-up protocols currently available do not appear to diagnose treatment failures and recurrences early enough to provide the best treatment to improve the survival rates of patients. The identification of biomarkers may aid in diagnosing, monitoring the progression, or predicting treatment outcomes in HNSCC. The present study aimed to evaluate whether cluster of differentiation (CD) 3ζ chain expression may serve as a biomarker for the early detection of recurrent or persistent HNSCC. However, in a longitudinal study, a standardized method that allows consistent data comparisons in an inter-assay manner is critical. The present study reveals a method to monitor expression levels of CD3ζ over multiple time-points using flow cytometry. The present study validated the use of an internal control and normalization procedure for tracking alterations in CD3ζ expression in samples from patients with HNSCC, which were collected and assayed for a longitudinal study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,019

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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